More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01554 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 623 aa  1298    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  53.99 
 
 		 590 aa  618  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  48.69 
 
 		 607 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  50.49 
 
 		 593 aa  522  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  46.37 
 
 		 637 aa  493  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2574  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.05 
 
 		 610 aa  210  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.935867 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.95 
 
 		 577 aa  207  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.816613  normal  0.363157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2793  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.2 
 
 		 586 aa  207  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584085  decreased coverage  0.00000363421 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  30.86 
 
 		 749 aa  206  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.1 
 
 		 631 aa  206  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  29.39 
 
 		 740 aa  205  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  30 
 
 		 638 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  31.92 
 
 		 560 aa  204  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  28.82 
 
 		 725 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  29.02 
 
 		 725 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.62 
 
 		 653 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2740  glycogen branching enzyme  29.57 
 
 		 736 aa  200  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  30.08 
 
 		 606 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1127  glycoside hydrolase family 13 protein  30.16 
 
 		 648 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  30.49 
 
 		 728 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03375  glycogen branching enzyme  30.64 
 
 		 728 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  31.37 
 
 		 765 aa  198  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0241  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.2 
 
 		 581 aa  198  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  31.32 
 
 		 640 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  31.78 
 
 		 735 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.29 
 
 		 608 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  32.35 
 
 		 841 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.37 
 
 		 732 aa  195  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1559  glycogen branching enzyme  28.82 
 
 		 659 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17070  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  30.32 
 
 		 654 aa  195  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  30.66 
 
 		 731 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5166  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.93 
 
 		 594 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2616  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.98 
 
 		 589 aa  194  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058115 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  29.76 
 
 		 729 aa  194  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3650  glycogen branching enzyme  31.57 
 
 		 735 aa  194  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.93 
 
 		 561 aa  194  6e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0132  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.56 
 
 		 629 aa  193  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  29.91 
 
 		 726 aa  193  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  28.72 
 
 		 680 aa  193  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1840  glycogen branching enzyme  29.14 
 
 		 659 aa  193  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1347  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.7 
 
 		 593 aa  193  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3760  glycogen branching enzyme  30.04 
 
 		 749 aa  193  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  30.93 
 
 		 745 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.37 
 
 		 629 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0767542 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.3 
 
 		 630 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3633  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.26 
 
 		 577 aa  191  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.48 
 
 		 739 aa  191  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3233  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.85 
 
 		 638 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0840  glycogen branching enzyme  32.43 
 
 		 643 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.049249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2027  alpha amylase catalytic region  28.46 
 
 		 876 aa  190  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748072  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0558  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.19 
 
 		 650 aa  190  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000187675  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2758  glycogen branching enzyme  31.72 
 
 		 745 aa  190  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.92 
 
 		 613 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.714045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0238  glycogen branching enzyme  29.81 
 
 		 645 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0276021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  28.47 
 
 		 834 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  29.51 
 
 		 716 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  29.71 
 
 		 743 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  29.71 
 
 		 743 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.64 
 
 		 626 aa  189  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  29.71 
 
 		 743 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  31.01 
 
 		 648 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  29.24 
 
 		 728 aa  189  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  29.24 
 
 		 775 aa  188  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2011  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.37 
 
 		 638 aa  188  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.935259  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29 
 
 		 761 aa  187  3e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.983775 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.3 
 
 		 618 aa  188  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.21 
 
 		 721 aa  188  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3504  glycogen branching enzyme  30.15 
 
 		 645 aa  187  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2934  glycogen branching enzyme  31.51 
 
 		 745 aa  187  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  29.83 
 
 		 743 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  30.16 
 
 		 768 aa  187  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  30.16 
 
 		 768 aa  187  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2836  glycogen branching enzyme  31.65 
 
 		 745 aa  187  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4999  glycogen branching enzyme  29.58 
 
 		 645 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  30.49 
 
 		 740 aa  186  9e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.1 
 
 		 659 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2403  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.1 
 
 		 659 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2907  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.75 
 
 		 584 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172907  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.06 
 
 		 614 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  28.86 
 
 		 737 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3714  glycogen branching enzyme  30.08 
 
 		 728 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470927  normal  0.781278 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03284  glycogen branching enzyme  30 
 
 		 728 aa  185  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0237204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0282  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30 
 
 		 728 aa  185  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.890555  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3911  glycogen branching enzyme  30 
 
 		 728 aa  185  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03237  hypothetical protein  30 
 
 		 728 aa  185  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0399493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4744  glycogen branching enzyme  30.08 
 
 		 728 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0280  glycogen branching enzyme  30 
 
 		 728 aa  185  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.388281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3632  glycogen branching enzyme  30 
 
 		 728 aa  185  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  30.91 
 
 		 736 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  29.17 
 
 		 749 aa  185  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3113  glycogen branching enzyme  29.94 
 
 		 638 aa  184  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  29.83 
 
 		 722 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  31.06 
 
 		 695 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0267  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.68 
 
 		 579 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.640878  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  27.29 
 
 		 755 aa  184  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6209  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.93 
 
 		 621 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  29.22 
 
 		 630 aa  183  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  30.44 
 
 		 621 aa  183  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.02 
 
 		 633 aa  183  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.85 
 
 		 731 aa  183  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>