More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5485 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5485  aminotransferase  100 
 
 		 288 aa  588  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.787347  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1805  aminotransferase  87.54 
 
 		 285 aa  517  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4602  aminotransferase  73.24 
 
 		 288 aa  434  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.042075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5063  aminotransferase  73.59 
 
 		 288 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1102  aminotransferase  70.4 
 
 		 290 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5073  aminotransferase  67.63 
 
 		 307 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.068349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0999  aminotransferase  67.63 
 
 		 290 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.471878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0585  aminotransferase  59.3 
 
 		 293 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0951  aminotransferase  57.34 
 
 		 295 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0832  aminotransferase  56.84 
 
 		 295 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0300  aminotransferase  57.4 
 
 		 284 aa  325  7e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3773  aminotransferase  57.25 
 
 		 284 aa  318  5e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.783601  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0626  aminotransferase  54.77 
 
 		 284 aa  311  6.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1251  aminotransferase  52.26 
 
 		 293 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2277  aminotransferase  54.18 
 
 		 287 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3729  aminotransferase  48.94 
 
 		 287 aa  277  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2216  aminotransferase  53.62 
 
 		 287 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0891  aminotransferase  53.62 
 
 		 287 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.413724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2837  aminotransferase  50.54 
 
 		 286 aa  264  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0508  aminotransferase  48 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6433  aminotransferase  45.39 
 
 		 281 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0868  aminotransferase  46.91 
 
 		 287 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896873 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  31.88 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  31.8 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  31.2 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  32.59 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  30.27 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  32.41 
 
 		 287 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  33.2 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3604  branched-chain amino acid aminotransferase  29.11 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  30.04 
 
 		 322 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4909  aminotransferase class IV  33.33 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  31.91 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  31.23 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  33.96 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  32.28 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  28.47 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  29.17 
 
 		 320 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  30.28 
 
 		 309 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  31.56 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  30.27 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  28.85 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  29.6 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  30.8 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  29.58 
 
 		 307 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  29.82 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  28.25 
 
 		 307 aa  105  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  26.8 
 
 		 322 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  29.15 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  33.46 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  27.82 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  29.69 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  27.07 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  26.94 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  29.14 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  27.44 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  31.02 
 
 		 307 aa  102  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  30.35 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  32.06 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  28.36 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  27.07 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  27.82 
 
 		 307 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  28 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  28 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  29.79 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  30.86 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  27.44 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  28.95 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  28.78 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  28.95 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  25.95 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  28.78 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  25.52 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  29.86 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  28.06 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  28.31 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3128  branched chain amino acid aminotransferase  29.77 
 
 		 318 aa  99.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6151  branched-chain amino acid aminotransferase  29.52 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  29.92 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  30.19 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  28.37 
 
 		 312 aa  99.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2509  branched-chain amino acid aminotransferase  28.46 
 
 		 295 aa  99  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 		 306 aa  99  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  26.91 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  28.03 
 
 		 312 aa  98.2  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  26.48 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  26.71 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  25.59 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  26.76 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  30.11 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  26.76 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  26.76 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  32.82 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  26.76 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  30.04 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  29.83 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  28.77 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  25.87 
 
 		 305 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>