77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4945 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  78.43 
 
 		 203 aa  317  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  69.71 
 
 		 204 aa  255  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  69.62 
 
 		 228 aa  239  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  71.62 
 
 		 230 aa  235  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  73.1 
 
 		 228 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  53.65 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  55 
 
 		 204 aa  185  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  51.2 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  62.22 
 
 		 169 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  58.57 
 
 		 165 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  56.8 
 
 		 154 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  53.97 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  53.97 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  52.38 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  40.46 
 
 		 146 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  43.55 
 
 		 123 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  34.8 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  35.79 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  36.69 
 
 		 145 aa  105  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  42.37 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  42.28 
 
 		 147 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  35.97 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  40.3 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  38.84 
 
 		 147 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  40.62 
 
 		 167 aa  98.6  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  34.08 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  40.6 
 
 		 168 aa  95.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  39.67 
 
 		 156 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  87  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  36.5 
 
 		 134 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  31.47 
 
 		 142 aa  81.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  31.11 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  35.42 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  31.75 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  32.19 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  36.43 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  31.72 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  35 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  32.69 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  30.71 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  32.2 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  31.54 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  32.59 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  29.5 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  30.58 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  29.03 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  28.46 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  24.14 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  29.37 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  27.4 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  27.91 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  25.2 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  31.94 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  28.69 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  31.25 
 
 		 134 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  30.56 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  29.6 
 
 		 111 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  28.33 
 
 		 119 aa  52.4  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  30.43 
 
 		 145 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  27.41 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  31.82 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  28 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  28.67 
 
 		 129 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  33.57 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  26.92 
 
 		 129 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  29.08 
 
 		 161 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  28.57 
 
 		 161 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  27.2 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  30.89 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  27.48 
 
 		 140 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  23.53 
 
 		 144 aa  42  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  24.03 
 
 		 166 aa  42  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  35.82 
 
 		 151 aa  41.6  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  35.82 
 
 		 151 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>