More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4765 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0067  ABC transporter related  90.84 
 
 		 502 aa  913    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1818  ABC transporter related  80.97 
 
 		 501 aa  793    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.013948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.66 
 
 		 489 aa  758    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126474 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1938  ABC transporter related  74.69 
 
 		 494 aa  736    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4765  ABC transporter related  100 
 
 		 502 aa  993    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.991546  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0485  ABC transporter related  71.93 
 
 		 490 aa  696    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  42.53 
 
 		 823 aa  330  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  42.27 
 
 		 827 aa  329  9e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  42.12 
 
 		 823 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  40.12 
 
 		 822 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  39.79 
 
 		 484 aa  298  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  38.8 
 
 		 832 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  38.79 
 
 		 536 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  39.38 
 
 		 828 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  38.54 
 
 		 852 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  37.2 
 
 		 842 aa  277  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  36.84 
 
 		 830 aa  276  8e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1048  ABC transporter related  36.56 
 
 		 549 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  36.76 
 
 		 863 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  38.43 
 
 		 505 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  35.71 
 
 		 838 aa  273  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  38.1 
 
 		 840 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  36.71 
 
 		 859 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0763  ABC transporter related  39.29 
 
 		 504 aa  266  8e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  36.38 
 
 		 840 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3584  ABC transporter related  36.71 
 
 		 873 aa  256  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282341  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3223  ABC transporter related  34.26 
 
 		 573 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  35.06 
 
 		 840 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3805  ABC transporter related protein  40.38 
 
 		 261 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  31.75 
 
 		 504 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1317  ABC transporter related protein  48.87 
 
 		 238 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  47.26 
 
 		 247 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1318  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 242 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  32.11 
 
 		 527 aa  203  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  49.78 
 
 		 233 aa  202  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 247 aa  201  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  50.46 
 
 		 240 aa  201  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  32.04 
 
 		 508 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  51.15 
 
 		 233 aa  200  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  50.68 
 
 		 234 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 		 247 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 235 aa  198  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  51.8 
 
 		 241 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  30.52 
 
 		 516 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  31.4 
 
 		 541 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  47.51 
 
 		 247 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  46.93 
 
 		 246 aa  196  9e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 233 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  48.39 
 
 		 233 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  47 
 
 		 249 aa  196  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 		 237 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  47.56 
 
 		 241 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  49.08 
 
 		 238 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  31.5 
 
 		 510 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 235 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  46.93 
 
 		 236 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  29.85 
 
 		 496 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  48.2 
 
 		 239 aa  193  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  48.21 
 
 		 237 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  48.18 
 
 		 247 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  48.18 
 
 		 247 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  50.7 
 
 		 240 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 237 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4915  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 		 238 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  43.97 
 
 		 233 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 237 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 237 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 237 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  52.05 
 
 		 234 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  32.06 
 
 		 511 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 237 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  48.18 
 
 		 253 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5743  ABC transporter related  31.49 
 
 		 516 aa  192  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  48.18 
 
 		 247 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 236 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  47.49 
 
 		 238 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  31.61 
 
 		 529 aa  190  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  47.35 
 
 		 235 aa  190  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1698  ABC transporter related  47.77 
 
 		 242 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.937087 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03959  fused D-allose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  27.07 
 
 		 510 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3904  ABC transporter related protein  27.07 
 
 		 510 aa  189  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03919  hypothetical protein  27.07 
 
 		 510 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3939  D-allose transporter ATP-binding protein  27.07 
 
 		 510 aa  189  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.650182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  50.44 
 
 		 234 aa  189  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  46.19 
 
 		 237 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 237 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  46.19 
 
 		 237 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3029  ABC transporter related  30.71 
 
 		 537 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.860382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.19 
 
 		 241 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.58 
 
 		 237 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.19 
 
 		 237 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  45.61 
 
 		 238 aa  189  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.98 
 
 		 233 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.19 
 
 		 237 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  47.56 
 
 		 238 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 234 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1498  ATPase  32.03 
 
 		 513 aa  188  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  46.58 
 
 		 238 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  50.46 
 
 		 236 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3804  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 247 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0651651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>