More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5743 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5743  ABC transporter related  100 
 
 		 516 aa  1030    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.77 
 
 		 497 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  44.92 
 
 		 508 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  40.33 
 
 		 495 aa  385  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  41.06 
 
 		 497 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  39.06 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  38.82 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.36 
 
 		 506 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2586  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 511 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.49 
 
 		 511 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  37.95 
 
 		 496 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4703  ABC transporter related  43.79 
 
 		 540 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.73 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2258  ABC transporter related  41.18 
 
 		 492 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0621772  normal  0.0357164 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  39.92 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  43.18 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 		 494 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  37.5 
 
 		 492 aa  366  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 		 507 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  40.76 
 
 		 501 aa  365  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  40.12 
 
 		 509 aa  364  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 		 494 aa  364  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0822  ABC transporter related  37.98 
 
 		 502 aa  363  4e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.688061  hitchhiker  0.00171866 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  38.46 
 
 		 512 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 		 494 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 		 494 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 		 494 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  38.24 
 
 		 496 aa  362  8e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  38.99 
 
 		 494 aa  362  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.73 
 
 		 492 aa  361  2e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 		 523 aa  361  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 		 511 aa  360  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  38.04 
 
 		 496 aa  359  6e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 494 aa  359  8e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  40.84 
 
 		 497 aa  358  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.37 
 
 		 494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 508 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  38.82 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 		 523 aa  356  5e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  40.32 
 
 		 502 aa  356  5.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2757  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 511 aa  356  5.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0547  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.05 
 
 		 503 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0138907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.52 
 
 		 504 aa  355  8.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 523 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  36.88 
 
 		 513 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.2 
 
 		 507 aa  355  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 		 525 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 523 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  38.41 
 
 		 501 aa  355  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  42.07 
 
 		 500 aa  355  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 		 507 aa  355  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  38.7 
 
 		 499 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  42.68 
 
 		 528 aa  355  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  40.94 
 
 		 495 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.35 
 
 		 503 aa  354  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  38.04 
 
 		 501 aa  354  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  38.9 
 
 		 501 aa  354  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  36.88 
 
 		 513 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  38.65 
 
 		 525 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2036  ABC transporter related  40.16 
 
 		 492 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  38.57 
 
 		 504 aa  353  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4210  xylose transporter ATP-binding subunit  41.15 
 
 		 519 aa  353  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  38.78 
 
 		 515 aa  353  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  38.78 
 
 		 515 aa  353  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  38.83 
 
 		 501 aa  353  5.9999999999999994e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3415  xylose transporter ATP-binding subunit  40.12 
 
 		 511 aa  352  8e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2614  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.5 
 
 		 504 aa  352  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  39.3 
 
 		 508 aa  351  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3048  ABC transporter related protein  36.95 
 
 		 513 aa  352  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  40.65 
 
 		 519 aa  351  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6335  xylose transporter ATP-binding subunit  41.43 
 
 		 519 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3704  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.88 
 
 		 503 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  37.04 
 
 		 499 aa  350  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  37.76 
 
 		 501 aa  350  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6503  xylose transporter ATP-binding subunit  40.67 
 
 		 519 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399148  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6737  xylose transporter ATP-binding subunit  40.67 
 
 		 519 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.020966  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2340  xylose transporter ATP-binding subunit  40.12 
 
 		 525 aa  349  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264239  normal  0.0150515 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  36.82 
 
 		 501 aa  349  6e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3476  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.44 
 
 		 501 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  39.64 
 
 		 501 aa  349  7e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6035  xylose transporter ATP-binding subunit  41.24 
 
 		 519 aa  349  8e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0730737  normal  0.8225 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2340  xylose transporter ATP-binding subunit  40.95 
 
 		 519 aa  349  8e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  37.93 
 
 		 501 aa  349  8e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.19 
 
 		 525 aa  348  9e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  38.86 
 
 		 525 aa  348  9e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6326  xylose transporter ATP-binding subunit  40.67 
 
 		 519 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22602  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  39.92 
 
 		 519 aa  348  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  39.36 
 
 		 505 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  37.63 
 
 		 501 aa  348  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12280  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  42.13 
 
 		 505 aa  348  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171798  normal  0.428152 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 		 515 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3961  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.45 
 
 		 515 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 		 515 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  37.96 
 
 		 516 aa  348  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0775  xylose transporter ATP-binding subunit  39.84 
 
 		 512 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  37.65 
 
 		 507 aa  348  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 		 515 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2620  xylose transporter ATP-binding subunit  39.17 
 
 		 519 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>