More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4703 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4703  ABC transporter related  100 
 
 		 540 aa  1044    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5743  ABC transporter related  43.79 
 
 		 516 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1825  ABC transporter related  41.37 
 
 		 505 aa  355  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0788496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  41.46 
 
 		 505 aa  352  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  40.58 
 
 		 513 aa  346  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  36.31 
 
 		 496 aa  344  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  41.9 
 
 		 514 aa  338  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  37.45 
 
 		 495 aa  335  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  41.82 
 
 		 515 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  40.16 
 
 		 512 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  36.92 
 
 		 503 aa  334  3e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  36.12 
 
 		 495 aa  333  5e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  41.09 
 
 		 520 aa  333  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  40.44 
 
 		 513 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  40.57 
 
 		 514 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.37 
 
 		 512 aa  331  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  39.24 
 
 		 516 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  40.16 
 
 		 512 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  40.16 
 
 		 512 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  38.03 
 
 		 501 aa  330  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  37.78 
 
 		 501 aa  330  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  41.45 
 
 		 517 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  40.57 
 
 		 513 aa  330  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2258  ABC transporter related  38.83 
 
 		 492 aa  330  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0621772  normal  0.0357164 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  41.33 
 
 		 514 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  43.49 
 
 		 499 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  34.42 
 
 		 492 aa  329  1.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  41.33 
 
 		 514 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  41.9 
 
 		 500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  40.81 
 
 		 516 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  39.04 
 
 		 506 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  41.26 
 
 		 506 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  34.69 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  36.07 
 
 		 502 aa  327  3e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  41.92 
 
 		 495 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.43 
 
 		 527 aa  327  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2036  ABC transporter related  38.55 
 
 		 492 aa  327  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  37.98 
 
 		 501 aa  327  5e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  37.7 
 
 		 501 aa  326  6e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  40.16 
 
 		 501 aa  326  6e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  39.39 
 
 		 519 aa  326  6e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  38.88 
 
 		 524 aa  326  7e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  35.26 
 
 		 501 aa  326  8.000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.45 
 
 		 517 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  41.13 
 
 		 514 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  39.02 
 
 		 504 aa  324  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  38.72 
 
 		 524 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  42.66 
 
 		 540 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  38.72 
 
 		 524 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  38.72 
 
 		 524 aa  324  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  38.23 
 
 		 512 aa  324  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  39.84 
 
 		 523 aa  324  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0946  ABC transporter related  40.12 
 
 		 526 aa  324  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516195  normal  0.0273292 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  36.97 
 
 		 501 aa  323  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  37.73 
 
 		 501 aa  323  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 517 aa  323  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0881  ABC transporter related  39.14 
 
 		 526 aa  323  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218523  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  35.83 
 
 		 497 aa  322  7e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  38.04 
 
 		 512 aa  322  8e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  37.91 
 
 		 499 aa  322  9.000000000000001e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  38.82 
 
 		 495 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  36.97 
 
 		 499 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.91 
 
 		 499 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  39.31 
 
 		 510 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  39.76 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  36.77 
 
 		 501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  37.35 
 
 		 497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  35.83 
 
 		 500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.91 
 
 		 499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  36.77 
 
 		 501 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  36.77 
 
 		 501 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  36.77 
 
 		 501 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  36.77 
 
 		 501 aa  320  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  36.77 
 
 		 501 aa  320  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  40.71 
 
 		 517 aa  321  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  40.71 
 
 		 517 aa  321  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  35.86 
 
 		 504 aa  320  3.9999999999999996e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  38.42 
 
 		 513 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  40.59 
 
 		 517 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  40.55 
 
 		 517 aa  320  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.52 
 
 		 517 aa  320  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  38.62 
 
 		 524 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 		 517 aa  320  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 		 517 aa  320  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  36.15 
 
 		 516 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  39.68 
 
 		 509 aa  319  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  38.13 
 
 		 513 aa  319  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  36.58 
 
 		 504 aa  319  7.999999999999999e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  36.15 
 
 		 516 aa  319  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.84 
 
 		 516 aa  319  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  36.14 
 
 		 495 aa  318  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  37.15 
 
 		 499 aa  319  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  39.07 
 
 		 516 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  40.04 
 
 		 519 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  36.15 
 
 		 516 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  36.77 
 
 		 501 aa  319  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.23 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  36.36 
 
 		 516 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  34.35 
 
 		 501 aa  318  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  40.38 
 
 		 517 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>