More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3804 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3804  ABC transporter related protein  100 
 
 
247 aa  497  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0651651  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1317  ABC transporter related protein  55.6 
 
 
238 aa  261  4.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
235 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  45.92 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  47.86 
 
 
243 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 
241 aa  214  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  47.19 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  42.86 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  44.96 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  49.37 
 
 
270 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  48.1 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  46.78 
 
 
234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.5 
 
 
254 aa  211  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  41.3 
 
 
231 aa  211  7.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.06 
 
 
237 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.06 
 
 
237 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.06 
 
 
237 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.06 
 
 
237 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.06 
 
 
237 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.87 
 
 
236 aa  211  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  46.98 
 
 
245 aa  210  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  47.19 
 
 
239 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  46.35 
 
 
234 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3040  ABC transporter related  46.94 
 
 
253 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
235 aa  210  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  44.44 
 
 
234 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  45.96 
 
 
236 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  47.06 
 
 
247 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  48.51 
 
 
251 aa  209  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  47.06 
 
 
247 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  46.78 
 
 
235 aa  208  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  41.88 
 
 
236 aa  208  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  48.95 
 
 
251 aa  209  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  44.02 
 
 
235 aa  208  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  47.62 
 
 
239 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  46.98 
 
 
237 aa  208  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.64 
 
 
241 aa  208  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  45.53 
 
 
247 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.64 
 
 
233 aa  208  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  44.64 
 
 
237 aa  208  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  44.64 
 
 
237 aa  208  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.64 
 
 
237 aa  208  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  44.64 
 
 
237 aa  208  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.64 
 
 
237 aa  208  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.49 
 
 
233 aa  207  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.64 
 
 
237 aa  207  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  47.06 
 
 
250 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  45.26 
 
 
249 aa  207  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  46.64 
 
 
251 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  47.06 
 
 
247 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  43.29 
 
 
231 aa  206  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  46.75 
 
 
239 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  47.84 
 
 
249 aa  206  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  46.35 
 
 
237 aa  206  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  44.87 
 
 
234 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  48.29 
 
 
248 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  45.06 
 
 
242 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  45.11 
 
 
247 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  45.11 
 
 
247 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  45.53 
 
 
253 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.68 
 
 
251 aa  205  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  45.6 
 
 
255 aa  205  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  44.44 
 
 
234 aa  205  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3652  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.64 
 
 
233 aa  205  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  45.38 
 
 
247 aa  204  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  46.32 
 
 
238 aa  204  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.64 
 
 
237 aa  204  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  45.73 
 
 
249 aa  204  8e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2873  ABC transporter related  45.73 
 
 
252 aa  204  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296726  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  46.22 
 
 
251 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  46.22 
 
 
251 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  46.22 
 
 
252 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  42.92 
 
 
234 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  45.49 
 
 
236 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  45.06 
 
 
233 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  46.22 
 
 
252 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  45.49 
 
 
233 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  43.59 
 
 
235 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
233 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  45.06 
 
 
233 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  45.45 
 
 
258 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  43.83 
 
 
239 aa  202  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  46.22 
 
 
247 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  44.68 
 
 
247 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  46.22 
 
 
247 aa  203  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3247  putative high-affinity branched-chain amino acid transport protein, ATP binding protein  46.72 
 
 
231 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0529  ABC transporter related  43.91 
 
 
240 aa  202  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000281948  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1938  ABC transporter related  46.98 
 
 
494 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323376  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
251 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  46.78 
 
 
233 aa  202  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  45.92 
 
 
233 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 
234 aa  201  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  47.19 
 
 
242 aa  202  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4057  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 
251 aa  201  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  45.26 
 
 
234 aa  201  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2169  ABC transporter related  46.15 
 
 
235 aa  201  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  41.7 
 
 
237 aa  201  8e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  44.21 
 
 
236 aa  201  9e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  46.15 
 
 
236 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0998  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.44 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>