More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0114 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3307  ABC transporter related  87.5 
 
 		 259 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  79.58 
 
 		 260 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  78.33 
 
 		 260 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  71.13 
 
 		 249 aa  357  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2431  polar amino acid ABC transporter ATPase  64.61 
 
 		 256 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21470  amino acid ABC transporter, ATP binding component  60.8 
 
 		 269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5772  ABC transporter related  61.57 
 
 		 336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2630  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.94 
 
 		 278 aa  298  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00585721  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1133  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.8 
 
 		 278 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.772292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  58.33 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5173  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  60.08 
 
 		 261 aa  292  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1886  ABC transporter related  62.04 
 
 		 286 aa  291  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  60.98 
 
 		 253 aa  291  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  60.83 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  57.92 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59.41 
 
 		 246 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  56.25 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  55.83 
 
 		 243 aa  284  8e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3163  ABC transporter related  57.32 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.816893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  55.83 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  58.26 
 
 		 257 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 		 251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  57.02 
 
 		 249 aa  281  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.45 
 
 		 273 aa  281  7.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.85 
 
 		 244 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.96 
 
 		 244 aa  281  8.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  55.83 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  56.4 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  55.6 
 
 		 244 aa  278  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  57.69 
 
 		 242 aa  278  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  58.33 
 
 		 243 aa  278  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  57.37 
 
 		 252 aa  278  8e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  57.87 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  57.92 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.67 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  56.25 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  60.34 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  56.85 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  57.77 
 
 		 267 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  57.32 
 
 		 247 aa  275  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  56.67 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  56.9 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.72 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  54.37 
 
 		 259 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  55.42 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  56.85 
 
 		 243 aa  274  8e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.41 
 
 		 242 aa  274  8e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  55 
 
 		 247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.92 
 
 		 278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  57.26 
 
 		 255 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.56 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  55.42 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  55 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  58.72 
 
 		 249 aa  273  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  55.83 
 
 		 247 aa  272  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 		 240 aa  273  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  56.07 
 
 		 265 aa  272  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  57.74 
 
 		 269 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  55.6 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  57.02 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  57.14 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  56.67 
 
 		 249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  55.24 
 
 		 262 aa  271  6e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  52.92 
 
 		 244 aa  271  6e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  55 
 
 		 240 aa  271  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  55.6 
 
 		 244 aa  271  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  56.33 
 
 		 269 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  56.49 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  57.38 
 
 		 246 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  55.97 
 
 		 263 aa  270  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  55.78 
 
 		 263 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  54.98 
 
 		 254 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  54.55 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  58.13 
 
 		 251 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  54.58 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  56.97 
 
 		 246 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  53.12 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  55.28 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  56.15 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  56.15 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.25 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  53.26 
 
 		 260 aa  268  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  52.85 
 
 		 246 aa  268  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  54.98 
 
 		 263 aa  269  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  53.09 
 
 		 244 aa  269  4e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>