79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0665 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  100 
 
 		 463 aa  958    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  29.48 
 
 		 624 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  36.46 
 
 		 1061 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  28.08 
 
 		 828 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  22.96 
 
 		 470 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  23.67 
 
 		 759 aa  97.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  25.23 
 
 		 769 aa  97.4  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  24.56 
 
 		 765 aa  96.3  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  23.4 
 
 		 760 aa  95.9  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  30.32 
 
 		 507 aa  96.3  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  23.27 
 
 		 486 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  25.91 
 
 		 632 aa  89.7  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  25.97 
 
 		 738 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  28.28 
 
 		 1036 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  23.49 
 
 		 1285 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  28.42 
 
 		 757 aa  87.8  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  28.64 
 
 		 1039 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  21.4 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  23.35 
 
 		 723 aa  81.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  24.29 
 
 		 717 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  24.28 
 
 		 1172 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  24.51 
 
 		 695 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  24.28 
 
 		 1172 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  24.56 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  26.18 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  24 
 
 		 717 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  24.14 
 
 		 717 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  23.86 
 
 		 788 aa  77.4  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  23.57 
 
 		 882 aa  77  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  24.06 
 
 		 782 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  24.05 
 
 		 755 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  20.96 
 
 		 749 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  20.74 
 
 		 531 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  23.66 
 
 		 1145 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  22.03 
 
 		 524 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  25.76 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  19.51 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  19.51 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  25.87 
 
 		 1000 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  23.86 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  20.11 
 
 		 725 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  22.17 
 
 		 857 aa  64.7  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  22.54 
 
 		 798 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  22.39 
 
 		 843 aa  63.9  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  23.02 
 
 		 697 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  20.69 
 
 		 842 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  24.35 
 
 		 605 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0022  ATPase-like protein  25.77 
 
 		 548 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  27.33 
 
 		 636 aa  60.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  23.43 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  20.91 
 
 		 770 aa  57.8  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  31.2 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  21.96 
 
 		 774 aa  57.4  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  25.95 
 
 		 777 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  25.95 
 
 		 777 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  25.95 
 
 		 777 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  24.08 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  27.53 
 
 		 763 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  27.53 
 
 		 763 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  19.72 
 
 		 771 aa  55.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  28.67 
 
 		 777 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  22.5 
 
 		 900 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  25.54 
 
 		 775 aa  54.3  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  28.28 
 
 		 775 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  24.86 
 
 		 777 aa  53.9  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  20.73 
 
 		 874 aa  53.9  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  20.73 
 
 		 874 aa  53.9  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  22.48 
 
 		 472 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  20.81 
 
 		 624 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  24.29 
 
 		 776 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  21.55 
 
 		 485 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  22.92 
 
 		 613 aa  50.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  22.87 
 
 		 746 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  25.85 
 
 		 777 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  22.87 
 
 		 746 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  20.83 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  23.38 
 
 		 955 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  22.38 
 
 		 606 aa  44.3  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  26.72 
 
 		 612 aa  43.5  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>