More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2043 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  100 
 
 
725 aa  1469    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  60.47 
 
 
854 aa  826    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  100 
 
 
708 aa  1435    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  45.54 
 
 
842 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  45.54 
 
 
842 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  36.73 
 
 
884 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.29 
 
 
889 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.41 
 
 
873 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  25 
 
 
869 aa  177  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  25.5 
 
 
866 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  26.2 
 
 
891 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  24.25 
 
 
868 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.08 
 
 
887 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  24.25 
 
 
868 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  24.93 
 
 
868 aa  174  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  23.85 
 
 
868 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  23.85 
 
 
868 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  24.11 
 
 
868 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  24.48 
 
 
869 aa  174  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  26.46 
 
 
865 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  24.61 
 
 
868 aa  171  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  38.76 
 
 
907 aa  171  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  23.75 
 
 
868 aa  170  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  26.78 
 
 
842 aa  170  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  23.85 
 
 
868 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.12 
 
 
869 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  26.22 
 
 
871 aa  167  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  28.91 
 
 
826 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.21 
 
 
840 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.21 
 
 
971 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  35.58 
 
 
950 aa  156  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0682  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  27.76 
 
 
873 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  22.82 
 
 
887 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  23.93 
 
 
971 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  26.23 
 
 
788 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  35.35 
 
 
867 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.44 
 
 
903 aa  147  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  24.86 
 
 
963 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  34 
 
 
906 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  26.7 
 
 
791 aa  145  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  28.57 
 
 
890 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  27.42 
 
 
885 aa  138  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  27.39 
 
 
885 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  35.86 
 
 
821 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  24.58 
 
 
837 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.01 
 
 
852 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  27.1 
 
 
870 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  33.05 
 
 
886 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.95 
 
 
811 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  30.38 
 
 
871 aa  117  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.75 
 
 
891 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  26.43 
 
 
874 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0540  PEP-utilising protein mobile region  31.1 
 
 
558 aa  112  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  26.69 
 
 
825 aa  110  9.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  48.76 
 
 
971 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4026  PEP-utilising enzyme, mobile region  29.45 
 
 
537 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.756461  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  46.36 
 
 
414 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  29.78 
 
 
892 aa  107  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  36.71 
 
 
1097 aa  107  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  47.62 
 
 
386 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  27.83 
 
 
956 aa  106  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.17 
 
 
902 aa  105  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.67 
 
 
797 aa  104  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0076  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  46.15 
 
 
408 aa  101  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.54 
 
 
959 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1184  PEP-utilising enzyme, mobile region  28.53 
 
 
592 aa  97.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.627285  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0511  hypothetical protein  32.34 
 
 
594 aa  95.9  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493067  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0459  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  46.53 
 
 
389 aa  96.3  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  46.15 
 
 
386 aa  96.3  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  47 
 
 
359 aa  94.4  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0515  hypothetical protein  31.5 
 
 
546 aa  94  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.18 
 
 
835 aa  94  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2434  Pyruvate, water dikinase  45 
 
 
434 aa  92  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1069  Pyruvate, water dikinase  41.07 
 
 
835 aa  90.1  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  42.99 
 
 
765 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.64 
 
 
975 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1604  hypothetical protein  36.69 
 
 
602 aa  87.4  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1575  hypothetical protein  39.25 
 
 
610 aa  84.7  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0270865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2100  hypothetical protein  40.32 
 
 
609 aa  84  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2917  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  39.83 
 
 
692 aa  84  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  25.5 
 
 
854 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  41 
 
 
586 aa  83.6  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4575  PEP-utilising protein mobile region  28.77 
 
 
312 aa  83.2  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848155  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1996  hypothetical protein  40.19 
 
 
622 aa  80.9  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0906204  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39 
 
 
810 aa  80.1  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  30.6 
 
 
795 aa  79.7  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4241  hypothetical protein  29.03 
 
 
560 aa  79  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  30.6 
 
 
795 aa  78.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  37.62 
 
 
760 aa  77  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  40.82 
 
 
787 aa  77.4  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2203  phosphoenolpyruvate synthase  42.55 
 
 
789 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000184256  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1972  PEP-utilising protein mobile region  39.05 
 
 
770 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  35.45 
 
 
760 aa  75.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  43.02 
 
 
790 aa  76.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  40.2 
 
 
809 aa  75.9  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  38.14 
 
 
801 aa  75.1  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  34.65 
 
 
780 aa  75.1  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2277  Pyruvate, water dikinase  46.67 
 
 
773 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1774  pyruvate, water dikinase  35.83 
 
 
780 aa  74.7  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  41.18 
 
 
812 aa  74.7  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>