More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2277 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2277  Pyruvate, water dikinase  100 
 
 
773 aa  1548    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3388  phosphoenolpyruvate synthase  41.41 
 
 
775 aa  551  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954883  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1774  pyruvate, water dikinase  39.62 
 
 
780 aa  533  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1972  PEP-utilising protein mobile region  43.44 
 
 
770 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0910  phosphoenolpyruvate synthase  34.76 
 
 
831 aa  477  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3993  PEP-utilising protein mobile region  38.23 
 
 
761 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.800573  normal  0.608484 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3944  Pyruvate, water dikinase  38.3 
 
 
761 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  32.19 
 
 
758 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  31.85 
 
 
758 aa  384  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  31.39 
 
 
758 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.42 
 
 
810 aa  339  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  30.65 
 
 
810 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  29.35 
 
 
809 aa  327  6e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  33.99 
 
 
765 aa  325  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  29.64 
 
 
781 aa  320  6e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  28.79 
 
 
764 aa  319  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  28.43 
 
 
779 aa  319  1e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  28.47 
 
 
782 aa  317  7e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  29.85 
 
 
809 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  29.21 
 
 
794 aa  307  5.0000000000000004e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  28.99 
 
 
799 aa  307  5.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  28.63 
 
 
754 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  30 
 
 
812 aa  301  4e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 
760 aa  300  6e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  28.18 
 
 
780 aa  295  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  28.45 
 
 
788 aa  293  7e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  27.85 
 
 
758 aa  293  9e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  28.52 
 
 
824 aa  292  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  28.54 
 
 
762 aa  290  9e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  28.75 
 
 
785 aa  285  3.0000000000000004e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  28.01 
 
 
785 aa  283  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  28.86 
 
 
761 aa  282  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  27.44 
 
 
769 aa  278  3e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  28.86 
 
 
762 aa  272  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  26.24 
 
 
805 aa  272  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  27.93 
 
 
793 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  25.8 
 
 
758 aa  266  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  26.6 
 
 
809 aa  264  4e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  28.64 
 
 
791 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  25.38 
 
 
758 aa  262  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0799  phosphoenolpyruvate synthase  26.87 
 
 
801 aa  261  3e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  25.35 
 
 
757 aa  261  4e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  26.73 
 
 
761 aa  261  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  28.17 
 
 
792 aa  260  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  28.17 
 
 
792 aa  260  6e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  28.75 
 
 
760 aa  259  9e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  29.42 
 
 
806 aa  259  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  28.04 
 
 
792 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  28.88 
 
 
815 aa  259  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  28.04 
 
 
792 aa  258  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  28.04 
 
 
792 aa  258  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  28.04 
 
 
792 aa  258  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  28.04 
 
 
792 aa  258  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  26.55 
 
 
805 aa  258  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  25.74 
 
 
758 aa  258  4e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  27.85 
 
 
792 aa  258  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2757  phosphoenolpyruvate synthase  27.25 
 
 
825 aa  257  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112987 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  28.04 
 
 
792 aa  257  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  27.92 
 
 
792 aa  257  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  27.52 
 
 
798 aa  256  8e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  27.69 
 
 
795 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  28.99 
 
 
796 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1823  phosphoenolpyruvate synthase  27.72 
 
 
792 aa  256  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  27.6 
 
 
792 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  26.95 
 
 
821 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  27.6 
 
 
792 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1433  phosphoenolpyruvate synthase  27.25 
 
 
806 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0770  phosphoenolpyruvate synthase  27.29 
 
 
800 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  27.6 
 
 
792 aa  254  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  27.6 
 
 
792 aa  254  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  28 
 
 
793 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  27.43 
 
 
798 aa  251  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  26.63 
 
 
803 aa  251  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  27.56 
 
 
812 aa  250  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  28.3 
 
 
789 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  28.3 
 
 
789 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  28.17 
 
 
808 aa  249  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  28.21 
 
 
804 aa  249  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3585  phosphoenolpyruvate synthase  26.82 
 
 
812 aa  249  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.737105 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0034  phosphoenolpyruvate synthase  26.85 
 
 
806 aa  248  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  28.3 
 
 
789 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1744  phosphoenolpyruvate synthase  27.52 
 
 
791 aa  248  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1972  phosphoenolpyruvate synthase  27.11 
 
 
805 aa  247  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  27.06 
 
 
789 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  28.77 
 
 
789 aa  247  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2758  phosphoenolpyruvate synthase  26.82 
 
 
792 aa  247  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1816  phosphoenolpyruvate synthase  29.22 
 
 
803 aa  247  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1493  phosphoenolpyruvate synthase  29.22 
 
 
803 aa  247  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.514917  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2456  phosphoenolpyruvate synthase  26.11 
 
 
792 aa  246  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  28.22 
 
 
814 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  27.93 
 
 
792 aa  246  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4106  phosphoenolpyruvate synthase  28.76 
 
 
798 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.826747  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2164  phosphoenolpyruvate synthase  30.83 
 
 
812 aa  246  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  26.7 
 
 
803 aa  244  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  26.85 
 
 
792 aa  244  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1363  phosphoenolpyruvate synthase  29.28 
 
 
799 aa  244  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  29.44 
 
 
788 aa  243  9e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  28.32 
 
 
789 aa  243  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  27.74 
 
 
787 aa  243  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  26.34 
 
 
792 aa  242  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0176662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>