280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1249 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1249  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  100 
 
 
420 aa  829    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252669 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0245  deoxyribodipyrimidine photolyase  46.82 
 
 
298 aa  193  5e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.51093  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0218  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  49.05 
 
 
303 aa  189  8e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0011  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  52.6 
 
 
270 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.161683  normal  0.149093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4249  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  43.55 
 
 
270 aa  180  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0940  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  44.34 
 
 
278 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1867  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  45.54 
 
 
293 aa  170  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107933  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1589  DNA photolyase FAD-binding  43.64 
 
 
271 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1389  putative deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.43 
 
 
405 aa  116  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359515  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3370  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  39.05 
 
 
410 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2809  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  40.48 
 
 
403 aa  109  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29652  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.1 
 
 
454 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0617  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  32.71 
 
 
396 aa  99.8  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.07426  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1302  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.1 
 
 
456 aa  99.8  9e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.674491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  39.13 
 
 
468 aa  97.8  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.17 
 
 
469 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0994  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.76 
 
 
462 aa  96.7  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  35.52 
 
 
472 aa  96.7  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4658  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.33 
 
 
476 aa  96.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0553081  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1604  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.5 
 
 
486 aa  96.3  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0320  DNA photolyase FAD-binding subunit  35.11 
 
 
440 aa  94.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1458  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  28.04 
 
 
384 aa  94.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.89887  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.11 
 
 
486 aa  94.4  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0811  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.7 
 
 
475 aa  94  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0814  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.47 
 
 
490 aa  93.6  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0439  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.71 
 
 
435 aa  93.2  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0112  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.95 
 
 
484 aa  93.2  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00531501  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  36.9 
 
 
471 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  36.9 
 
 
471 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.41 
 
 
497 aa  92.4  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4692  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.65 
 
 
476 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3589  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.39 
 
 
483 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.42 
 
 
488 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61640  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.93 
 
 
481 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0940349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5309  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.93 
 
 
477 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.66 
 
 
477 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0739  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.99 
 
 
480 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1611  deoxyribodipyrimidine photolyase  33 
 
 
445 aa  91.3  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2257  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.47 
 
 
442 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.65 
 
 
492 aa  90.1  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  32.65 
 
 
481 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.34 
 
 
463 aa  90.1  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2196  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.95 
 
 
519 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0767  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.42 
 
 
475 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0780  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.42 
 
 
475 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431367  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1380  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.67 
 
 
470 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866986  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34592  cry-dash from the cryptochrome/photolyase family  35.91 
 
 
610 aa  89.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0080  deoxyribodipyrimidine photolyase, cyclobutane pyrimidine dimer-specific  30.09 
 
 
469 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000198558  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.13 
 
 
481 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10630  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.22 
 
 
450 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0877345 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0998  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.33 
 
 
453 aa  89  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.26 
 
 
482 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3356  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.36 
 
 
483 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617341  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1613  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.1 
 
 
425 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0151  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.48 
 
 
497 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0953516  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3030  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.67 
 
 
451 aa  87.8  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.334621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.56 
 
 
483 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2714  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.82 
 
 
493 aa  88.2  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0866  deoxyribodipyrimidine photo-lyase (photoreactivating enzyme)  28.33 
 
 
479 aa  88.2  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.13 
 
 
481 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1224  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.89 
 
 
497 aa  87.8  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5899  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.95 
 
 
519 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0769953  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0343  cryptochrome, DASH family  30.64 
 
 
488 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2178  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.95 
 
 
519 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240707  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4086  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.63 
 
 
449 aa  87  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3384  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.82 
 
 
512 aa  86.7  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4333  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  52.7 
 
 
435 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1491  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.21 
 
 
499 aa  86.7  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.675954 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0817  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.32 
 
 
471 aa  86.3  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3098  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.46 
 
 
487 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.383524  normal  0.0341678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4676  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.71 
 
 
500 aa  86.3  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499221 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1562  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.76 
 
 
471 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.51951  normal  0.490223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2021  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.96 
 
 
445 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128536 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.68 
 
 
482 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2143  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.32 
 
 
471 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.96 
 
 
445 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29275  predicted protein  34.21 
 
 
551 aa  86.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2595  cryptochrome, DASH family  35.47 
 
 
478 aa  86.3  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0775599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2084  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.96 
 
 
445 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  30.24 
 
 
476 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3184  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  31.37 
 
 
476 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2469  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.53 
 
 
475 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205711 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0815  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.36 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.752894  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1152  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.81 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0172656  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.83 
 
 
484 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.09 
 
 
476 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4450  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.84 
 
 
480 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3953  cryptochrome, DASH family  35.86 
 
 
515 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.48 
 
 
479 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5488  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.11 
 
 
518 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  30.73 
 
 
476 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4047  Deoxyribodipyrimidine photolyase-like  34.3 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00445605  normal  0.106433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4270  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.87 
 
 
473 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397965  normal  0.444789 
 
 
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NC_009091  P9301_15471  DNA photolyase-like protein  27.08 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.111669  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_2095  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.11 
 
 
500 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1145  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.36 
 
 
476 aa  84.7  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1166  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.37 
 
 
493 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009952  Dshi_2318  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.98 
 
 
476 aa  84.7  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3193  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  29.41 
 
 
476 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008816  A9601_15621  DNA photolyase-like protein  25.89 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.299984  n/a   
 
 
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