More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4333 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4333  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  100 
 
 
435 aa  848    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1613  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  56.61 
 
 
425 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0534  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  53.94 
 
 
419 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0776453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4270  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  50.57 
 
 
473 aa  358  8e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397965  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5903  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.91 
 
 
436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.61 
 
 
487 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  43.44 
 
 
454 aa  270  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4658  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.86 
 
 
476 aa  270  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0553081  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0575  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.15 
 
 
468 aa  268  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2879  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.36 
 
 
470 aa  268  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2541  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.73 
 
 
466 aa  268  2e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.272644 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.03 
 
 
479 aa  265  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1491  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  39.35 
 
 
499 aa  261  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.675954 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4086  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.83 
 
 
449 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.85 
 
 
491 aa  256  6e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4704  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.47 
 
 
459 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.940834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0529  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.71 
 
 
421 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0312273  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4692  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.78 
 
 
476 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1437  DNA photolyase FAD-binding  35.88 
 
 
514 aa  248  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5488  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  39.82 
 
 
518 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  33.84 
 
 
471 aa  245  9e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.07 
 
 
469 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.18 
 
 
452 aa  244  3e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  33.84 
 
 
471 aa  243  6e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2257  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.18 
 
 
442 aa  242  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5899  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.6 
 
 
519 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0769953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2178  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.6 
 
 
519 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240707  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1262  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.51 
 
 
463 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103305  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2196  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.82 
 
 
519 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2095  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.49 
 
 
500 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.71 
 
 
482 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3554  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.45 
 
 
450 aa  239  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00327054  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  36.34 
 
 
472 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.64 
 
 
445 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2217  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.43 
 
 
525 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0778  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  42.57 
 
 
453 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2084  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.64 
 
 
445 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2021  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.64 
 
 
445 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.34 
 
 
483 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.35 
 
 
482 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3184  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  30.69 
 
 
476 aa  236  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1444  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.3 
 
 
483 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0241  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.33 
 
 
475 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.581458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1562  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.85 
 
 
471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.51951  normal  0.490223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  30.9 
 
 
476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1604  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.01 
 
 
486 aa  234  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10630  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.57 
 
 
450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0877345 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.71 
 
 
478 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3193  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  30.41 
 
 
476 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.96 
 
 
475 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2665  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.99 
 
 
501 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1122  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.45 
 
 
457 aa  231  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000025981 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3030  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.35 
 
 
451 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.334621  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0810  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  32.32 
 
 
470 aa  231  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.42 
 
 
463 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  31.03 
 
 
476 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2935  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.67 
 
 
476 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3187  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  31.03 
 
 
476 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1113  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.6 
 
 
474 aa  230  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289495  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0813  hypothetical protein  30.35 
 
 
486 aa  229  6e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.18 
 
 
475 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0733  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.71 
 
 
472 aa  229  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.7 
 
 
486 aa  229  7e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  30.84 
 
 
476 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00657  hypothetical protein  34.71 
 
 
456 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00668  deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD-binding  34.71 
 
 
473 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0625  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.73 
 
 
472 aa  227  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2947  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.71 
 
 
472 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2928  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.73 
 
 
472 aa  225  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0755  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.73 
 
 
472 aa  225  9e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.391934  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3180  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  30.85 
 
 
469 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1364  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.07 
 
 
473 aa  223  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0723  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.35 
 
 
472 aa  223  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.867142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1623  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.41 
 
 
482 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0798  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.92 
 
 
472 aa  222  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1801  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.94 
 
 
488 aa  223  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.09 
 
 
481 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.34 
 
 
481 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.52 
 
 
481 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1921  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.16 
 
 
488 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.2 
 
 
488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2305  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.76 
 
 
467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000471562  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.27 
 
 
484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1880  DNA photolyase  34.84 
 
 
483 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.64 
 
 
476 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1615  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.01 
 
 
471 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1651  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.57 
 
 
493 aa  220  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309463  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3356  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.26 
 
 
483 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617341  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0811  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.64 
 
 
475 aa  220  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0729  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.94 
 
 
483 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1272  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.35 
 
 
434 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0814  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.58 
 
 
490 aa  219  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5849  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.9 
 
 
505 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1224  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.55 
 
 
497 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.55 
 
 
492 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  36.06 
 
 
468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1145  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.41 
 
 
476 aa  217  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1302  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.73 
 
 
456 aa  217  4e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.674491  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.48 
 
 
477 aa  217  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1134  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.65 
 
 
477 aa  216  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>