69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0343 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  320  5e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  47.95 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  48.63 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 157 aa  140  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  44.52 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  43.15 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  44.35 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 153 aa  90.5  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  34.93 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  33.56 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  34.93 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0728  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0099  transcriptional regulator  26.5 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.36846  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1859  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000190016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  23.31 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 154 aa  44.3  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  21.52 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  25.61 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  20.69 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  21.6 
 
 		 157 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 141 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  25.71 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.69 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32.69 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 149 aa  40.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  28.26 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>