More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26350 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_26350  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 526 aa  1072    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228589 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  43.42 
 
 		 506 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  38.26 
 
 		 507 aa  310  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  37.31 
 
 		 489 aa  306  5.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  36.92 
 
 		 494 aa  298  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0459  extracellular solute-binding protein  37.3 
 
 		 504 aa  296  7e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435025  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  36.09 
 
 		 507 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  37.04 
 
 		 492 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  35.41 
 
 		 493 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  37.69 
 
 		 492 aa  289  9e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.31 
 
 		 492 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.31 
 
 		 479 aa  284  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  33.91 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.08 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  33.48 
 
 		 509 aa  259  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  32.21 
 
 		 505 aa  259  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1058  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 		 563 aa  254  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0919  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  34.83 
 
 		 539 aa  253  5.000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.654123  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  34.03 
 
 		 496 aa  230  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  34.03 
 
 		 496 aa  230  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  31.7 
 
 		 501 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5441  extracellular solute-binding protein  32.69 
 
 		 497 aa  226  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.876365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  31.28 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  32.06 
 
 		 495 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4355  extracellular solute-binding protein family 5  33.62 
 
 		 495 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0355555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6472  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  31.95 
 
 		 495 aa  211  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0139  extracellular solute-binding protein  30.98 
 
 		 502 aa  210  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  30.51 
 
 		 499 aa  209  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3049  extracellular solute-binding protein family 5  31.38 
 
 		 503 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1196  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  30.02 
 
 		 488 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.419054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 		 534 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  28.13 
 
 		 503 aa  169  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.99 
 
 		 535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 522 aa  163  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  27.39 
 
 		 610 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.86 
 
 		 510 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.25 
 
 		 519 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.23 
 
 		 541 aa  154  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.69 
 
 		 524 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.66 
 
 		 503 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 503 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 		 512 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 512 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 512 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 512 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 510 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 515 aa  146  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0191  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 495 aa  145  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 		 520 aa  143  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.32 
 
 		 520 aa  143  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3985  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 499 aa  143  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  28.33 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 501 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  26.53 
 
 		 556 aa  140  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.26 
 
 		 529 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 510 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  28.48 
 
 		 560 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 501 aa  137  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 517 aa  136  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.95 
 
 		 528 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.95 
 
 		 528 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 504 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.91 
 
 		 546 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 		 516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 544 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  26.33 
 
 		 515 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4796  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 		 532 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 505 aa  134  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 529 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  29.52 
 
 		 502 aa  134  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.45 
 
 		 509 aa  133  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  29.13 
 
 		 502 aa  133  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  29.7 
 
 		 524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  26.44 
 
 		 556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.56 
 
 		 528 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.53 
 
 		 528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  29.36 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.56 
 
 		 528 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  30.23 
 
 		 504 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4682  extracellular solute-binding protein family 5  28 
 
 		 532 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 500 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  28.83 
 
 		 504 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 523 aa  130  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 529 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.64 
 
 		 529 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.53 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  25.6 
 
 		 515 aa  128  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 490 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  27.81 
 
 		 531 aa  127  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.26 
 
 		 529 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 536 aa  127  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 505 aa  127  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 		 524 aa  127  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 530 aa  127  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  23.68 
 
 		 527 aa  127  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.33 
 
 		 495 aa  126  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>