More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09480 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 		 221 aa  440  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.31196  normal  0.583973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0083  ABC transporter related  52.15 
 
 		 212 aa  232  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.599688 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21600  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.12 
 
 		 214 aa  211  5.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0852  ABC transporter related protein  51.9 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1582  ABC transporter related protein  51.69 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1589  ABC transporter related protein  53.11 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11191  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3176  ABC transporter related protein  54.36 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  45.08 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  41.75 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  40.51 
 
 		 241 aa  154  9e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  41.97 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  39.38 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  42.72 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  42.08 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  38.6 
 
 		 247 aa  151  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  42.27 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  42.25 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  42.25 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  41.27 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04770  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.39 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  42.47 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  39.9 
 
 		 220 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  41.03 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.98 
 
 		 648 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.98 
 
 		 648 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  34 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  47.06 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.98 
 
 		 648 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.98 
 
 		 648 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  41.4 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  39.34 
 
 		 655 aa  148  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.98 
 
 		 648 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  37.26 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  42.25 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  38.86 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  39.62 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  36.92 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  39.9 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  41.45 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  38.81 
 
 		 221 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  40.76 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  44.62 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  39.38 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  41.45 
 
 		 647 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  40.93 
 
 		 653 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  38.31 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  38.02 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  40.31 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  43.17 
 
 		 408 aa  145  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  38.35 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  37.67 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  42.49 
 
 		 239 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  38.86 
 
 		 266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0678  ABC transporter, ATP-binding protein  45.4 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.586556  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2804  ABC transporter component  41.97 
 
 		 243 aa  144  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  43.59 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  42.59 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  38.5 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  42.93 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  38.97 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  41.03 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.03 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  39.38 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  44.9 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.62 
 
 		 647 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  44.39 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1616  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  38.34 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  43.43 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  40.47 
 
 		 663 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  39.09 
 
 		 652 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  41.97 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  42.62 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  40.1 
 
 		 682 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  39.81 
 
 		 645 aa  143  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15650  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.36 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.03 
 
 		 253 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.03 
 
 		 253 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.92 
 
 		 258 aa  142  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  40.1 
 
 		 682 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  40.19 
 
 		 648 aa  142  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  40.1 
 
 		 254 aa  142  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.19 
 
 		 648 aa  142  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0307  hypothetical protein  41.53 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  39.3 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  42.16 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  43.3 
 
 		 668 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  43.3 
 
 		 668 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  40.19 
 
 		 648 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  36.6 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  40.19 
 
 		 648 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.19 
 
 		 648 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.19 
 
 		 648 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.19 
 
 		 648 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  42.39 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  38.6 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>