285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4453 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  70.78 
 
 		 534 aa  674    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  72.02 
 
 		 515 aa  673    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  70.1 
 
 		 514 aa  638    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  73.11 
 
 		 526 aa  676    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4453  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 514 aa  997    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365428  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  70.87 
 
 		 514 aa  664    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4398  histidine ammonia-lyase  70.08 
 
 		 533 aa  637    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04180  histidine ammonia-lyase  66.41 
 
 		 544 aa  622  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0787941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0589  histidine ammonia-lyase  65.55 
 
 		 530 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00954752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0375  histidine ammonia-lyase  65.04 
 
 		 530 aa  616  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1584  histidine ammonia-lyase  62.6 
 
 		 517 aa  601  1e-170  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1421  histidine ammonia-lyase  73.48 
 
 		 514 aa  598  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  65.84 
 
 		 537 aa  591  1e-167  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  66.13 
 
 		 517 aa  587  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30680  histidine ammonia-lyase  64.46 
 
 		 518 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.86432  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6266  histidine ammonia-lyase  69.02 
 
 		 503 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  58.22 
 
 		 512 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  58.79 
 
 		 509 aa  508  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  57.81 
 
 		 512 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  47.89 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  43.42 
 
 		 516 aa  404  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  49.2 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  43 
 
 		 507 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  48.48 
 
 		 506 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  44.02 
 
 		 508 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  45.22 
 
 		 509 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  44.58 
 
 		 507 aa  377  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  48.67 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  41.77 
 
 		 505 aa  366  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  50 
 
 		 508 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  47.35 
 
 		 520 aa  365  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  50 
 
 		 508 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  50 
 
 		 508 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  44.04 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  44.04 
 
 		 513 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  44.47 
 
 		 513 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  45.49 
 
 		 516 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  47.97 
 
 		 499 aa  357  1.9999999999999998e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  44.27 
 
 		 513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  44.27 
 
 		 513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  44.74 
 
 		 510 aa  355  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3642  histidine ammonia-lyase  47.99 
 
 		 517 aa  354  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.556064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  44.06 
 
 		 513 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  40.98 
 
 		 489 aa  354  2.9999999999999997e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  45.14 
 
 		 506 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  45.25 
 
 		 507 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  45.14 
 
 		 506 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  45.14 
 
 		 506 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  45.14 
 
 		 506 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  44.29 
 
 		 510 aa  352  7e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  44.27 
 
 		 513 aa  352  8e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  44.27 
 
 		 513 aa  352  8e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  44.27 
 
 		 513 aa  352  8e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  44.33 
 
 		 510 aa  352  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  44.17 
 
 		 514 aa  352  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  42.77 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  44.9 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  47.4 
 
 		 526 aa  350  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  44.74 
 
 		 510 aa  350  4e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  43.94 
 
 		 511 aa  350  5e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  45.36 
 
 		 511 aa  349  7e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  46.48 
 
 		 536 aa  349  9e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  44.94 
 
 		 506 aa  348  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  44.19 
 
 		 524 aa  348  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  39.53 
 
 		 523 aa  347  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  40.93 
 
 		 522 aa  347  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  43.95 
 
 		 506 aa  347  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  41.38 
 
 		 510 aa  347  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  46.58 
 
 		 508 aa  347  4e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  44.57 
 
 		 498 aa  347  4e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  43.69 
 
 		 512 aa  346  5e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  44.83 
 
 		 510 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  43.56 
 
 		 513 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  44.66 
 
 		 511 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  43.45 
 
 		 511 aa  343  5.999999999999999e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  44.58 
 
 		 511 aa  342  9e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  44.02 
 
 		 507 aa  342  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  42.77 
 
 		 511 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  45.44 
 
 		 513 aa  342  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  40.24 
 
 		 538 aa  341  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  44.22 
 
 		 511 aa  340  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  43.81 
 
 		 507 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  45.75 
 
 		 518 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  45.97 
 
 		 518 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  45.78 
 
 		 507 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  43.65 
 
 		 510 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  45.57 
 
 		 507 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  40.04 
 
 		 497 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  45.57 
 
 		 507 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  44.79 
 
 		 507 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  45.57 
 
 		 529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  45.57 
 
 		 507 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  45.57 
 
 		 514 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  45.57 
 
 		 507 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  43.65 
 
 		 510 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  44.58 
 
 		 507 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  45.57 
 
 		 533 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  45.57 
 
 		 529 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  44.49 
 
 		 514 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1932  histidine ammonia-lyase  42.29 
 
 		 520 aa  336  5e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>