More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2984 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 306 aa  593  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  63.76 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  63.61 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  62.62 
 
 		 309 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  62.21 
 
 		 310 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  62.38 
 
 		 309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  63.23 
 
 		 310 aa  353  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  62.75 
 
 		 308 aa  352  5e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  61.09 
 
 		 311 aa  347  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  60.59 
 
 		 307 aa  345  7e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  59.08 
 
 		 311 aa  343  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  59.15 
 
 		 316 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  59.06 
 
 		 308 aa  338  7e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  57.32 
 
 		 315 aa  337  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  60 
 
 		 319 aa  335  7e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  56.04 
 
 		 324 aa  331  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  58.14 
 
 		 309 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  55.86 
 
 		 337 aa  326  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  58.96 
 
 		 315 aa  321  9.000000000000001e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  57.05 
 
 		 318 aa  317  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  59.02 
 
 		 310 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  57.62 
 
 		 310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  53.7 
 
 		 336 aa  308  5e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  59.33 
 
 		 308 aa  305  6e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  59.33 
 
 		 308 aa  305  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  59.33 
 
 		 308 aa  305  6e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  55.85 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  51.95 
 
 		 317 aa  301  8.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  55.37 
 
 		 306 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  57.53 
 
 		 306 aa  292  6e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  52.81 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  55.59 
 
 		 311 aa  289  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  54.93 
 
 		 312 aa  285  7e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  52.4 
 
 		 313 aa  282  6.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  53.53 
 
 		 311 aa  279  4e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  47.09 
 
 		 328 aa  255  7e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  51.79 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  43.55 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  44.76 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  41.2 
 
 		 315 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  41.2 
 
 		 315 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  39.02 
 
 		 314 aa  222  6e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 		 315 aa  222  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  41.2 
 
 		 315 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  41.2 
 
 		 315 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  44.03 
 
 		 318 aa  222  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  41.2 
 
 		 315 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  41.25 
 
 		 320 aa  221  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  40.86 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  40.53 
 
 		 315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  38.69 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  40.27 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 315 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  44.37 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  41.06 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  43.56 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  40.66 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  44.93 
 
 		 308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  44.04 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  38.14 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  43.65 
 
 		 297 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  40.72 
 
 		 312 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  42.23 
 
 		 308 aa  212  7e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 		 311 aa  212  7.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  38.78 
 
 		 297 aa  211  9e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  44.23 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  45.48 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  44.26 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  40.39 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  43.56 
 
 		 307 aa  209  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  38.59 
 
 		 311 aa  209  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  38.94 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 		 315 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  42.67 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  41.22 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  42.57 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  41.36 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  34.63 
 
 		 313 aa  205  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  42.3 
 
 		 301 aa  205  9e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  37.87 
 
 		 313 aa  205  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  34.63 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>