More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1404 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  70.85 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  59.72 
 
 		 243 aa  239  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  54.66 
 
 		 290 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  58.54 
 
 		 279 aa  231  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  53.21 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  55.56 
 
 		 267 aa  226  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  51.25 
 
 		 247 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  49.79 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  47.93 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  52.27 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  47.17 
 
 		 469 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  41.92 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  44.04 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  44.12 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  45.89 
 
 		 360 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  48.37 
 
 		 289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  47.54 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  43.58 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  43.78 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  39.17 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  45.92 
 
 		 225 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  42.22 
 
 		 311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  40.95 
 
 		 213 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  42.57 
 
 		 338 aa  141  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  40 
 
 		 213 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  41.95 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  43.72 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  42.72 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  42.15 
 
 		 290 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  40.5 
 
 		 285 aa  137  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  42.71 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  38.15 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  40.53 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  42.93 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  36.95 
 
 		 262 aa  131  9e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  40.61 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  43.3 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  38.16 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  37.6 
 
 		 352 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  40.77 
 
 		 434 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  37.61 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  34.26 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  37.56 
 
 		 299 aa  122  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  34.93 
 
 		 341 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  34.53 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  33.08 
 
 		 286 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  33.46 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  33.46 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  33.46 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  35.47 
 
 		 294 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  38.59 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  35.92 
 
 		 230 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  33.94 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  30.8 
 
 		 309 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  31.63 
 
 		 181 aa  102  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  34.68 
 
 		 200 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  34.68 
 
 		 200 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  33.09 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  31.34 
 
 		 185 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  33.66 
 
 		 288 aa  97.4  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  35.18 
 
 		 190 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  32.66 
 
 		 198 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  32.11 
 
 		 188 aa  95.1  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  38.55 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  32.55 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  31.8 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  33.17 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  31.05 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  34.19 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  30.86 
 
 		 253 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  32.16 
 
 		 190 aa  92.4  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  33.8 
 
 		 221 aa  92.4  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  34.31 
 
 		 174 aa  92.4  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  32.91 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  32.52 
 
 		 252 aa  92  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  31.47 
 
 		 192 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  34.33 
 
 		 208 aa  92  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  31.66 
 
 		 193 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  31.11 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  33.03 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  32.02 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  30.24 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  29.31 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  31.94 
 
 		 200 aa  90.1  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  29.86 
 
 		 186 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  34.27 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  29.9 
 
 		 230 aa  89.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  34.58 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  29.41 
 
 		 231 aa  89  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  31.65 
 
 		 189 aa  89  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  31.97 
 
 		 220 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  33.5 
 
 		 220 aa  88.6  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  32.73 
 
 		 199 aa  88.6  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  34.58 
 
 		 221 aa  88.6  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  31.95 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  34.08 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  30.88 
 
 		 263 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  33.88 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  34.62 
 
 		 171 aa  87.8  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>