More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1722 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  100 
 
 		 412 aa  816    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  62.34 
 
 		 412 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  62.88 
 
 		 400 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  58.29 
 
 		 422 aa  435  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  60.97 
 
 		 384 aa  433  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  57.54 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  59.14 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  56.86 
 
 		 399 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  58.73 
 
 		 401 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  58.17 
 
 		 418 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  56.78 
 
 		 390 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  56.23 
 
 		 407 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  55.73 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  57.95 
 
 		 419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  55.36 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  55.89 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  56.96 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  55.89 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  55.19 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  55.89 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  53.33 
 
 		 400 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  53.6 
 
 		 416 aa  386  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  54.34 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  54.77 
 
 		 413 aa  385  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  52.3 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13041  cysteine desulfurase iscS  53.68 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315275  hitchhiker  0.00290952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1307  aminotransferase class V  56.01 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  54.72 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  54.42 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1106  aminotransferase class V  57.25 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  52.27 
 
 		 401 aa  362  5.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1213  aminotransferase, class V  56.67 
 
 		 424 aa  359  4e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.885701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  45.29 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14810  cysteine desulfurase family protein  47.56 
 
 		 400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  44.9 
 
 		 388 aa  311  9e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  43.99 
 
 		 392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  43.15 
 
 		 392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  42.31 
 
 		 394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1361  aminotransferase class V  49.87 
 
 		 407 aa  306  6e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  43.88 
 
 		 396 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  44.13 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  44.47 
 
 		 409 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  42.31 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  43.61 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  41.98 
 
 		 384 aa  296  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  41.94 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  42.46 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  41.79 
 
 		 379 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  43.99 
 
 		 382 aa  291  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  42.31 
 
 		 394 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  42.75 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  43.44 
 
 		 398 aa  289  6e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  41.22 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  43.73 
 
 		 392 aa  288  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  40.51 
 
 		 396 aa  286  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  42.97 
 
 		 389 aa  285  7e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  44.9 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.21 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  42.05 
 
 		 403 aa  282  7.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  42.05 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  45.25 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  40.51 
 
 		 388 aa  280  4e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  42.39 
 
 		 394 aa  279  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  43.26 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  40.66 
 
 		 414 aa  275  9e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  47.44 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  38.97 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  41.6 
 
 		 402 aa  274  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  38.11 
 
 		 404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  42.16 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18960  cysteine desulfurase family protein  44.42 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.477328  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  41.24 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  40.98 
 
 		 383 aa  269  7e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  47.07 
 
 		 385 aa  269  7e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  41.03 
 
 		 407 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  38.87 
 
 		 398 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  38.87 
 
 		 398 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  42.09 
 
 		 396 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  43.56 
 
 		 381 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  41.96 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  40 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.75 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  46.51 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  43.3 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  41.54 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  40.57 
 
 		 381 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  40.55 
 
 		 385 aa  259  7e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  42.01 
 
 		 1139 aa  259  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  41.78 
 
 		 1143 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.05 
 
 		 400 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09940  cysteine desulfurase family protein  42.13 
 
 		 392 aa  258  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.128931  hitchhiker  0.00000254642 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  39.28 
 
 		 399 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  39.64 
 
 		 383 aa  255  8e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  40.83 
 
 		 401 aa  255  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06940  cysteine desulfurase family protein  41.21 
 
 		 395 aa  255  8e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.417246  normal  0.55711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  40.83 
 
 		 401 aa  255  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  41.09 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  41.69 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2773  aminotransferase class V  46.07 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  38.36 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>