298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0925 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0925  Camphor resistance CrcB protein  100 
 
 
163 aa  317  6e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.44689  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  56.25 
 
 
162 aa  101  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  48.57 
 
 
143 aa  80.5  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  43.27 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  44.34 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  41.58 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  45.54 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0240  Camphor resistance CrcB protein  53.06 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  41.28 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2659  camphor resistance protein CrcB  43.18 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.298553  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  36.84 
 
 
208 aa  67.8  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2392  Camphor resistance CrcB protein  39.84 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145973 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  39.47 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3965  Camphor resistance CrcB protein  40.37 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00934681  normal  0.343855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  40.71 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  31.97 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  36.84 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  36.84 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  37.29 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  38.94 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  40.5 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  36.75 
 
 
126 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  43.36 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  42.71 
 
 
120 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  39.81 
 
 
124 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5463  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation-like protein  41.89 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0532023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  41.12 
 
 
124 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  37.86 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
131 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  34.96 
 
 
129 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  33.59 
 
 
131 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  36.7 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 
119 aa  58.2  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  42.35 
 
 
128 aa  58.2  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  36.09 
 
 
128 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
134 aa  57.8  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 
126 aa  57.4  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  38.39 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 
118 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  44.58 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  31.09 
 
 
120 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  35.83 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 
118 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  42.17 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  30.77 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  30.77 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
124 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  44.58 
 
 
125 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  41.98 
 
 
169 aa  55.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A24  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
133 aa  55.1  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  32.06 
 
 
124 aa  55.1  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  32.48 
 
 
126 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 
118 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  34.58 
 
 
122 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0846  Integral membrane protein for chromosome condensation  38.98 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.523851  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  36.51 
 
 
129 aa  53.9  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  36.36 
 
 
128 aa  53.9  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  36.51 
 
 
124 aa  53.9  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  35.9 
 
 
130 aa  53.9  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  37.07 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  32.2 
 
 
118 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  28.77 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  32.21 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  51.67 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  32.2 
 
 
118 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0072  CrcB protein  42.25 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  32.11 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
124 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 
128 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  38.54 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  31.82 
 
 
126 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  28.69 
 
 
134 aa  52.4  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 
125 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  24.66 
 
 
134 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  24.66 
 
 
134 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 
154 aa  52.4  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  37.04 
 
 
122 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  24.66 
 
 
134 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  31.82 
 
 
126 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  39.32 
 
 
131 aa  52  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  37.19 
 
 
125 aa  52  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  35.83 
 
 
122 aa  52  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  37.5 
 
 
123 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 
129 aa  52  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  37.61 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  36.45 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  36.11 
 
 
123 aa  51.6  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  37.93 
 
 
133 aa  51.2  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  52.54 
 
 
113 aa  51.2  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  34.74 
 
 
127 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  32.85 
 
 
162 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  31.93 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 
127 aa  50.8  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  37.5 
 
 
119 aa  50.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  46.07 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0135  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>