More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0689 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 439 aa  865    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  53.88 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 414 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  38.61 
 
 		 417 aa  240  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 		 430 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 		 416 aa  221  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 420 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  35.87 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 417 aa  170  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 415 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 431 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 432 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 432 aa  143  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 450 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 421 aa  136  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 401 aa  136  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 411 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 461 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  24.44 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.44 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 432 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  28.82 
 
 		 408 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  22.92 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 420 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  28.19 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  20 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  20 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 426 aa  110  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 427 aa  106  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  26.11 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  26.11 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  26.91 
 
 		 415 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 441 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  22.72 
 
 		 410 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 428 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  26.86 
 
 		 411 aa  97.1  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 420 aa  96.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 402 aa  96.7  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 420 aa  96.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  26.03 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  26.03 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  26.03 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 420 aa  94  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 442 aa  94  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 421 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  21.34 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 416 aa  90.1  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  25.54 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  22.25 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.77 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.48 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.42 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  21.87 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.14 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.14 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  25.38 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  25.38 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.42 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  25.38 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  22.86 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  22.86 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4916  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  25.38 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  25.38 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  23 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  21.62 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>