61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4022 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_4022  anti-sigm factor, ChrR  100 
 
 		 213 aa  435  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0365  anti-ECFsigma factor  48.43 
 
 		 223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.931641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2756  anti-ECFsigma factor, ChrR  45.54 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1093  anti-sigma factor ChrR  45.54 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0416  anti-ECFsigma factor, ChrR  46.01 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2935  anti-ECFsigma factor, ChrR  44.81 
 
 		 214 aa  185  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.714383  normal  0.0760187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0090  anti sigma factor protein  41.48 
 
 		 230 aa  177  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0891  transcriptional activator ChrR  37.38 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0339  anti-sigma factor ChrR, putative  39.35 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0721  anti-Sigm factor, ChrR  35.43 
 
 		 224 aa  141  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.699177  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1867  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.56 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0487  anti-sigm factor, ChrR  38.71 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1042  transcriptional activator ChrR  33.63 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1553  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.95 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0550  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.55 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0517  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.64 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1618  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.99 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0275  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.72 
 
 		 227 aa  111  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1439  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.01 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3569  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4076  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.7 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1960  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.48 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0408517 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03283  hypothetical protein  28.77 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1630  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.2 
 
 		 235 aa  91.3  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2472  anti-sigm factor, ChrR  26.17 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.483016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002701  putative transcriptional activator ChrR  29.68 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1890  putative transcriptional activator  29.58 
 
 		 226 aa  88.2  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2958  transcriptional regulator  31.92 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3373  anti-sigma factor ChrR, putative  24.14 
 
 		 224 aa  72  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0996  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.63 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2276  anti-ECFsigma factor, ChrR  24.89 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2348  anti-ECFsigma factor, ChrR  24.46 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.527033  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2779  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.92 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.960019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1477  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.87 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.688237  normal  0.852126 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2466  anti-ECFsigma factor, ChrR  23.71 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2037  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.79 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.280175  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1985  transcriptional activator, putative  23.5 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1333  anti-ECFsigma factor, ChrR  22.6 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0130181  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01438  Transcription negative regulator ChrR  28.85 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1378  putative transcriptional activator  26.67 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857298  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2319  anti-ECFsigma factor, ChrR  22.87 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2598  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.22 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2712  anti-ECFsigma factor, ChrR  24.08 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1748  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.38 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0800571  hitchhiker  0.00180975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2323  anti-ECFsigma factor, ChrR  23.71 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.586398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2637  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.38 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1473  hypothetical protein  32.26 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1373  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.68 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.86738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1454  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.51 
 
 		 125 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0025  transcriptional activator anti-ECFsigma factor  32.1 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322497  normal  0.142099 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02219  predicted transcription negative regulator  25.51 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.279228  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1180  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.96 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1782  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.8 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336195  normal  0.05616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1906  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.39 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1969  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.5 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1362  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.47 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0893  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.8 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0881  anti-ECFsigma factor, ChrR  28 
 
 		 221 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3481  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.53 
 
 		 221 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0858  anti-ECFsigma factor, ChrR  28 
 
 		 221 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3233  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.58 
 
 		 220 aa  41.2  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.741075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>