15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1473 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1473  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  429  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1867  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.86 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947993 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4022  anti-sigm factor, ChrR  32.26 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0339  anti-sigma factor ChrR, putative  35.16 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1042  transcriptional activator ChrR  31.03 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1553  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.03 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4076  anti-ECFsigma factor, ChrR  28.7 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03283  hypothetical protein  33.72 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0891  transcriptional activator ChrR  31.43 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2779  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.82 
 
 		 246 aa  45.1  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.960019 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1439  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.96 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002701  putative transcriptional activator ChrR  31.17 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3373  anti-sigma factor ChrR, putative  37.74 
 
 		 224 aa  42  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1477  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.82 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.688237  normal  0.852126 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1890  putative transcriptional activator  30.23 
 
 		 226 aa  42  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>