More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3552 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3552  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  775    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5853  hypothetical protein  50.13 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6766  hypothetical protein  49.35 
 
 
390 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0355  hypothetical protein  49.61 
 
 
389 aa  355  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2419  hypothetical protein  48.58 
 
 
390 aa  352  5e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.337062 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5346  hypothetical protein  47.81 
 
 
390 aa  348  7e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3322  hypothetical protein  48.33 
 
 
392 aa  324  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0572768 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5727  hypothetical protein  48.19 
 
 
395 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0500191  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4805  MATE efflux family protein  45.33 
 
 
868 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371962  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1550  cystathionine gamma-lyase  35.89 
 
 
379 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1501  cystathionine gamma-lyase  35.89 
 
 
379 aa  230  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1630  Cystathionine beta-lyase  35.68 
 
 
386 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  38.71 
 
 
386 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  37.43 
 
 
391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  38.71 
 
 
386 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  37.43 
 
 
391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  38.44 
 
 
386 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  37.6 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  37.6 
 
 
392 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  37.6 
 
 
392 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  37.6 
 
 
392 aa  216  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  37.6 
 
 
392 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  37.6 
 
 
391 aa  216  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  36.39 
 
 
398 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  36.78 
 
 
392 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  33.68 
 
 
391 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  33.68 
 
 
411 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  38.01 
 
 
386 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  36.78 
 
 
391 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  36.87 
 
 
398 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  36.34 
 
 
396 aa  209  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  36.7 
 
 
398 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  37.23 
 
 
398 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  36.68 
 
 
397 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  32.54 
 
 
395 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  31.81 
 
 
406 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  33.33 
 
 
392 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  33.85 
 
 
392 aa  202  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  34.57 
 
 
418 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  33.15 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  33.78 
 
 
378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  36.86 
 
 
401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3477  cystathionine beta-lyase  35.79 
 
 
393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  35.37 
 
 
377 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  33.24 
 
 
423 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  33.78 
 
 
384 aa  199  9e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  32.39 
 
 
395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  32.64 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  33.51 
 
 
423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  35.83 
 
 
399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  34.23 
 
 
400 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  32.97 
 
 
405 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  33.42 
 
 
397 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  31.99 
 
 
407 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  31.52 
 
 
384 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  33.96 
 
 
397 aa  195  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2219  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  36.68 
 
 
377 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  32.43 
 
 
377 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  32.98 
 
 
377 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  32.61 
 
 
397 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  32.43 
 
 
377 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1990  cystathionine beta-lyase  36.91 
 
 
383 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.916692  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  30.54 
 
 
392 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  31.52 
 
 
384 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  35.88 
 
 
381 aa  195  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2008  Cystathionine gamma-lyase  36.68 
 
 
377 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.31334e-21 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  32.8 
 
 
394 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  33.95 
 
 
388 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  32.35 
 
 
397 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  33.24 
 
 
387 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  33.33 
 
 
392 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  32.16 
 
 
377 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  32.61 
 
 
397 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  32.91 
 
 
401 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  32.75 
 
 
396 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  31.38 
 
 
399 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  30.81 
 
 
393 aa  193  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  33.42 
 
 
397 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  32.16 
 
 
377 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  32.16 
 
 
377 aa  193  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  32.16 
 
 
377 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  32.25 
 
 
397 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  33.17 
 
 
401 aa  193  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  33.24 
 
 
397 aa  193  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1897  cystathionine gamma-synthase  33.51 
 
 
393 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.769233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  31.55 
 
 
399 aa  192  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  33.33 
 
 
393 aa  192  8e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  32.16 
 
 
377 aa  192  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  31.75 
 
 
392 aa  192  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  32.8 
 
 
390 aa  192  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  32.16 
 
 
377 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  31.04 
 
 
399 aa  192  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  33.07 
 
 
401 aa  191  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  36.15 
 
 
391 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  32.16 
 
 
377 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  31.38 
 
 
399 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  33.24 
 
 
397 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  31.36 
 
 
394 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  31.36 
 
 
390 aa  191  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.312528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  34.22 
 
 
377 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>