More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0750 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0750  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  488  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1176  hypothetical protein  97.56 
 
 
246 aa  480  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0174847  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1051  hypothetical protein  97.15 
 
 
246 aa  478  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0987  membrane fusion component of efflux system  54.47 
 
 
246 aa  265  5e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.872539  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1273  membrane fusion protein of the hefABC efflux system HefB  42.68 
 
 
245 aa  192  5e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0109811  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0687  selenocysteine-specific elongation factor SelB  40.65 
 
 
247 aa  169  3e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.866215  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0978  hypothetical protein  36.59 
 
 
232 aa  149  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00102809  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1441  putative efflux transporter  34.32 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00742524  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  26.09 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0139  secretion protein HlyD  23.91 
 
 
356 aa  72  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.18 
 
 
397 aa  72  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01875  hypothetical protein  32.5 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  28.04 
 
 
381 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1145  hypothetical protein  24.47 
 
 
371 aa  68.6  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.73 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  25.99 
 
 
368 aa  67  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  26.14 
 
 
376 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  25.45 
 
 
365 aa  65.9  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4286  RND family efflux transporter MFP subunit  27.83 
 
 
361 aa  65.5  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0188  RND family efflux transporter MFP subunit  26.52 
 
 
369 aa  64.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  28.07 
 
 
379 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  24.76 
 
 
410 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  27.19 
 
 
377 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  28.9 
 
 
520 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.2 
 
 
391 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  28.9 
 
 
520 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.61 
 
 
397 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003811  membrane-fusion protein  30.11 
 
 
343 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.21 
 
 
349 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  24.09 
 
 
358 aa  62.4  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1311  HlyD family secretion protein  24.66 
 
 
357 aa  62  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.13 
 
 
351 aa  62  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  23.02 
 
 
365 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  22.05 
 
 
373 aa  61.6  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  25.11 
 
 
368 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.23 
 
 
370 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3992  RND efflux system membrane fusion protein  32.28 
 
 
366 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.87 
 
 
380 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  21.43 
 
 
370 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  25.22 
 
 
403 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000228  membrane-fusion protein  25 
 
 
357 aa  60.1  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  21.27 
 
 
367 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  25.1 
 
 
382 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  26.21 
 
 
381 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  21.27 
 
 
367 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0618  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  26.64 
 
 
268 aa  59.3  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02529  putative multidrug resistance protein (substrate binding lipoprotein)  27.66 
 
 
403 aa  58.9  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  27.35 
 
 
382 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.19 
 
 
369 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  24 
 
 
366 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  23.45 
 
 
370 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.1 
 
 
387 aa  58.5  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  27.8 
 
 
288 aa  58.9  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2481  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.3 
 
 
367 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  25.82 
 
 
403 aa  58.9  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3333  RND family efflux transporter MFP subunit  25.79 
 
 
377 aa  58.9  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1316  secretion protein HlyD  23.4 
 
 
501 aa  58.5  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  29.7 
 
 
353 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  23.11 
 
 
390 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  23.21 
 
 
368 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  21.67 
 
 
402 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  22.41 
 
 
365 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.04 
 
 
407 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  19.46 
 
 
294 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  22.41 
 
 
365 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.21 
 
 
362 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  22.41 
 
 
365 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  22.41 
 
 
365 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  24.18 
 
 
394 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  22.41 
 
 
365 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 
433 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  22.41 
 
 
365 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  22.39 
 
 
368 aa  57  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1992  secretion protein HlyD  25.11 
 
 
374 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121396  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0980  RND family efflux transporter MFP subunit  20 
 
 
361 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5959  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.59 
 
 
383 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.42426  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  21.98 
 
 
365 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1475  secretion protein HlyD  20.83 
 
 
368 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  24.26 
 
 
409 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2404  secretion protein HlyD  25.1 
 
 
347 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2645  hypothetical protein  24.75 
 
 
310 aa  56.6  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  22.41 
 
 
365 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.6 
 
 
388 aa  56.6  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  23.04 
 
 
407 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.65 
 
 
380 aa  56.6  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0236  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.41 
 
 
379 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.94922  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.91 
 
 
409 aa  55.8  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  20.29 
 
 
337 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  28.57 
 
 
407 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.13 
 
 
448 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0739  RND family efflux transporter MFP subunit  28.47 
 
 
371 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  23.11 
 
 
424 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  21.74 
 
 
364 aa  55.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4143  RND family efflux transporter MFP subunit  32.26 
 
 
343 aa  55.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.478516 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.32 
 
 
397 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  23.18 
 
 
397 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  20 
 
 
409 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  22.83 
 
 
360 aa  55.5  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.11 
 
 
398 aa  55.5  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2146  RND family efflux transporter MFP subunit  21.34 
 
 
417 aa  55.5  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0449485  normal  0.0115764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>