278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1535 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1535  ribonuclease BN  100 
 
 
469 aa  905    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  41.72 
 
 
484 aa  339  5.9999999999999996e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3144  ribonuclease BN  42.48 
 
 
438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2359  ribonuclease BN  42.61 
 
 
437 aa  296  4e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.389707  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  46.78 
 
 
263 aa  192  9e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3200  ribonuclease BN  42.97 
 
 
258 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  38.21 
 
 
378 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1631  ribonuclease BN  31.44 
 
 
397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2153  ribonuclease BN  45.8 
 
 
260 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3221  ribonuclease BN  34.11 
 
 
278 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0865  ribonuclease BN  31.87 
 
 
342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.756909  normal  0.214041 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0260  ribonuclease BN  38.77 
 
 
270 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0711  ribonuclease BN  51.75 
 
 
191 aa  124  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2378  ribonuclease BN  34.53 
 
 
261 aa  97.4  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1009  ribonuclease BN  32.17 
 
 
301 aa  97.4  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  31.45 
 
 
349 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  29.82 
 
 
384 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0257  ribonuclease BN  33.96 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  32.03 
 
 
328 aa  90.9  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  31.14 
 
 
445 aa  87.8  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  31.79 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  25.81 
 
 
402 aa  84  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  23.85 
 
 
283 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  27.31 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  23.85 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  29.45 
 
 
306 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2816  ribonuclease BN  30.48 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  25.86 
 
 
320 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  22.77 
 
 
317 aa  77  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  26.62 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  29.69 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  26.62 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  25.99 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  25.39 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  27.53 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  26.57 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  24.21 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  24.47 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  28.31 
 
 
328 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  29.02 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  26.01 
 
 
324 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  29.31 
 
 
377 aa  73.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  29.19 
 
 
367 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  30.6 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  30.6 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  30.6 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  24.11 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  24.71 
 
 
360 aa  69.7  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  28.76 
 
 
417 aa  69.7  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  23.55 
 
 
286 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  27.27 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  30.94 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  27.72 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  26.29 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  23.3 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  23.3 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  23.3 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  23.3 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  23.3 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  23.3 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  25.76 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  27.12 
 
 
299 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  24.91 
 
 
414 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  25.19 
 
 
289 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  26.2 
 
 
328 aa  65.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  30 
 
 
371 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  24.92 
 
 
316 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  26.51 
 
 
325 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  23.33 
 
 
386 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1515  ribonuclease BN-like family protein  23.91 
 
 
314 aa  65.9  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  31.42 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  23.8 
 
 
392 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  23.66 
 
 
288 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  23.66 
 
 
288 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  27.11 
 
 
420 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  28.68 
 
 
299 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  26.25 
 
 
351 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  26.35 
 
 
331 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  25.88 
 
 
352 aa  63.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  29.3 
 
 
328 aa  63.9  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  25.35 
 
 
330 aa  63.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  27.31 
 
 
377 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  24.92 
 
 
296 aa  63.2  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  25.27 
 
 
386 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  26.44 
 
 
322 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  26.44 
 
 
322 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  27.56 
 
 
348 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  25 
 
 
443 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  25.26 
 
 
333 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  27.49 
 
 
341 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  30.45 
 
 
331 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  24.54 
 
 
324 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  27.13 
 
 
310 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  27.05 
 
 
408 aa  62.4  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  27.57 
 
 
316 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  27.24 
 
 
375 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  27.13 
 
 
310 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  25.18 
 
 
388 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  27 
 
 
463 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  24.63 
 
 
359 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>