More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3218 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0376  DNA mismatch repair protein MutL  58.75 
 
 		 709 aa  756    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.13305  normal  0.32452 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1289  DNA mismatch repair protein MutL  69.32 
 
 		 765 aa  946    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0629  DNA mismatch repair protein MutL  54.72 
 
 		 767 aa  695    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0007  DNA mismatch repair protein MutL  56.31 
 
 		 709 aa  704    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953905  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3218  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 738 aa  1449    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  31.35 
 
 		 665 aa  359  8e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  31.1 
 
 		 644 aa  342  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  30.43 
 
 		 649 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  32.02 
 
 		 692 aa  337  5.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  29.77 
 
 		 680 aa  335  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.07 
 
 		 628 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  30.05 
 
 		 659 aa  324  3e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  30.44 
 
 		 674 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  26.91 
 
 		 669 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  33.2 
 
 		 692 aa  317  5e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  29.93 
 
 		 674 aa  313  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  33.65 
 
 		 652 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  30.77 
 
 		 630 aa  298  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  32.08 
 
 		 641 aa  295  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2458  DNA mismatch repair protein MutL  34.28 
 
 		 711 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.593809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  32.74 
 
 		 670 aa  281  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  41.79 
 
 		 559 aa  271  4e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  43.85 
 
 		 602 aa  270  8e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  33.42 
 
 		 687 aa  269  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  44.78 
 
 		 647 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  43.42 
 
 		 650 aa  267  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  43.06 
 
 		 622 aa  266  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  43.65 
 
 		 585 aa  263  8e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  42.33 
 
 		 619 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  29.08 
 
 		 685 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  42.86 
 
 		 640 aa  261  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  46.4 
 
 		 606 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  44.38 
 
 		 612 aa  258  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  40.76 
 
 		 647 aa  258  3e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  46.2 
 
 		 620 aa  257  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  47.94 
 
 		 565 aa  258  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  40.76 
 
 		 656 aa  256  9e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  39.89 
 
 		 639 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  42.56 
 
 		 586 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  40.71 
 
 		 755 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  41.9 
 
 		 668 aa  255  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  42.21 
 
 		 605 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  39.64 
 
 		 605 aa  254  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  42.69 
 
 		 603 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  41.94 
 
 		 589 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  41.46 
 
 		 608 aa  254  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  35.48 
 
 		 644 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  41.19 
 
 		 631 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  44.67 
 
 		 629 aa  252  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  30.37 
 
 		 681 aa  252  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  36.02 
 
 		 647 aa  250  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  43.97 
 
 		 602 aa  250  8e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  36.02 
 
 		 647 aa  250  9e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  39.3 
 
 		 647 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  39.3 
 
 		 647 aa  249  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  39.3 
 
 		 647 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  37.19 
 
 		 575 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  39.3 
 
 		 647 aa  249  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  39.3 
 
 		 626 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  39.3 
 
 		 647 aa  249  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  39.3 
 
 		 626 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  37.01 
 
 		 695 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  37.69 
 
 		 574 aa  248  3e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  44.08 
 
 		 649 aa  248  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  32.63 
 
 		 669 aa  247  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  44.94 
 
 		 560 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  43.44 
 
 		 616 aa  247  6e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  42.98 
 
 		 613 aa  247  6e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  42.98 
 
 		 630 aa  247  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3217  DNA mismatch repair protein MutL  43.81 
 
 		 762 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0687703 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0323  DNA mismatch repair protein MutL  41.03 
 
 		 652 aa  245  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  40.69 
 
 		 566 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  43.14 
 
 		 603 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  45.27 
 
 		 633 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  40.87 
 
 		 615 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  42.6 
 
 		 661 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  40.12 
 
 		 670 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  42.86 
 
 		 566 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  42.65 
 
 		 691 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  40.36 
 
 		 730 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  44.97 
 
 		 633 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  45.12 
 
 		 635 aa  244  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  42.98 
 
 		 636 aa  244  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  43.11 
 
 		 582 aa  244  6e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  44.05 
 
 		 620 aa  244  6e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  40.9 
 
 		 603 aa  243  7e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  39.12 
 
 		 648 aa  243  9e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  42.86 
 
 		 608 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  46.63 
 
 		 641 aa  243  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  40.95 
 
 		 647 aa  243  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  42.26 
 
 		 566 aa  242  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  41.98 
 
 		 624 aa  242  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  38.58 
 
 		 606 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  41.21 
 
 		 661 aa  241  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  38.89 
 
 		 614 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  41.18 
 
 		 653 aa  240  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  42.31 
 
 		 667 aa  240  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  42.31 
 
 		 667 aa  240  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  40.92 
 
 		 615 aa  239  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  44.41 
 
 		 623 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>