More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5238 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
323 aa  657    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.63 
 
 
317 aa  329  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.13 
 
 
305 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.46 
 
 
315 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.79 
 
 
315 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 
307 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 
349 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 
360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
315 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 
325 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
368 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.06 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
361 aa  109  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
368 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 
350 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
312 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
328 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
589 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
321 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  29.02 
 
 
376 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
345 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
366 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.95 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
357 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
357 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
357 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.02 
 
 
354 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
358 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
314 aa  86.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.79 
 
 
365 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.18 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
358 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  28.32 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  26.35 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4123  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160562  normal  0.607841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239778  normal  0.124525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.05 
 
 
347 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.2 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  25.54 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  24.52 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671749  normal  0.0420203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
340 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4120  vitamin K epoxide reductase  26.35 
 
 
847 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.54 
 
 
466 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.54 
 
 
466 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.54 
 
 
466 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
344 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 
317 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4356  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.89 
 
 
368 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002734  UDP-glucose 4-epimerase  22.59 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106036  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  25.57 
 
 
854 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
311 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
305 aa  60.1  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
375 aa  60.1  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.688935  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.1 
 
 
298 aa  59.7  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 
350 aa  59.7  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00305624  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
349 aa  59.3  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2502  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.68 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211535 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2103  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.68 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  25.16 
 
 
320 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  29.26 
 
 
339 aa  57.4  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
355 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
303 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 
355 aa  56.6  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
374 aa  56.6  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2555  vitamin K epoxide reductase  26.24 
 
 
862 aa  55.8  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  27.92 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2213  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.08 
 
 
355 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
349 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
347 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2911  UDP-glucose 4-epimerase  27.72 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2285  UDP-glucose 4-epimerase  28.04 
 
 
351 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1988  DNA polymerase 3, epsilon subunit  26.33 
 
 
870 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.04 
 
 
335 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>