256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3684 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 247 aa  509  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  37 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  39.59 
 
 		 218 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  38.68 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  40.5 
 
 		 589 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  40 
 
 		 593 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  35.61 
 
 		 226 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  39.22 
 
 		 592 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  49.15 
 
 		 641 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  35.21 
 
 		 587 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  38.39 
 
 		 606 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  36.32 
 
 		 602 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  34.34 
 
 		 565 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  32.5 
 
 		 610 aa  98.6  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  32.24 
 
 		 578 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  30.73 
 
 		 574 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  38.1 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  34.43 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  31.6 
 
 		 576 aa  92  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  28.37 
 
 		 602 aa  90.1  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  39.86 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1748  hypothetical protein  33.14 
 
 		 275 aa  89.4  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499382  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  30.77 
 
 		 596 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  28.65 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  32.16 
 
 		 581 aa  87  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  28.19 
 
 		 589 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  37.96 
 
 		 594 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  27.72 
 
 		 595 aa  82.4  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  30.48 
 
 		 589 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  28.5 
 
 		 596 aa  82  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  28.16 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  43.64 
 
 		 599 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  29.6 
 
 		 576 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  28.91 
 
 		 617 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  30.8 
 
 		 599 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  28.8 
 
 		 615 aa  76.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  31.91 
 
 		 605 aa  76.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  25.13 
 
 		 598 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  27.69 
 
 		 652 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  32.68 
 
 		 504 aa  73.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  27.96 
 
 		 599 aa  72  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  33.51 
 
 		 616 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  32.33 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  25.66 
 
 		 596 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  32.12 
 
 		 589 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1817  hypothetical protein  37.08 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  28.22 
 
 		 499 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1868  hypothetical protein  30.46 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  30.73 
 
 		 602 aa  65.5  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  27.62 
 
 		 604 aa  65.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  27.05 
 
 		 619 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1493  hypothetical protein  28.31 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  31.11 
 
 		 763 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  31.11 
 
 		 763 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  31.11 
 
 		 748 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  31.11 
 
 		 748 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  31.11 
 
 		 763 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  30.6 
 
 		 763 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  31.11 
 
 		 748 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3825  hypothetical protein  25.24 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  31.11 
 
 		 748 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1814  hypothetical protein  28.03 
 
 		 199 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0941  hypothetical protein  24.76 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00274384  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  28.29 
 
 		 735 aa  55.8  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  44.29 
 
 		 811 aa  55.8  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0446  Rhs element Vgr protein  29.85 
 
 		 762 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232565  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  44.29 
 
 		 1094 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2082  Rhs element Vgr protein  29.85 
 
 		 762 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1893  Rhs element Vgr protein  29.85 
 
 		 762 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0797  Rhs element Vgr protein  29.85 
 
 		 762 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0709  Rhs element Vgr protein  29.85 
 
 		 762 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.730029  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2009  Rhs element Vgr protein  29.85 
 
 		 762 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  25.12 
 
 		 612 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0740  Rhs element Vgr protein  29.85 
 
 		 762 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1035  Rhs element Vgr protein  29.85 
 
 		 762 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  29.53 
 
 		 697 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  29.1 
 
 		 644 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1880  hypothetical protein  25.71 
 
 		 349 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  29.1 
 
 		 782 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  29.1 
 
 		 782 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0853  hypothetical protein  27.96 
 
 		 183 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  32.79 
 
 		 712 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  43.04 
 
 		 979 aa  53.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  31.11 
 
 		 645 aa  52.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0853  hypothetical protein  26.49 
 
 		 193 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04713  Rhs element Vgr protein  43.04 
 
 		 564 aa  52.8  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  31.91 
 
 		 646 aa  52.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04253  Rhs element Vgr protein  50 
 
 		 612 aa  52.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  26.87 
 
 		 618 aa  52.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  40 
 
 		 928 aa  52.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0663  hypothetical protein  24.83 
 
 		 193 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  28 
 
 		 794 aa  52  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  27.14 
 
 		 611 aa  52  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  29.72 
 
 		 693 aa  52  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  26.25 
 
 		 680 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  28.22 
 
 		 702 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 853 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  26.9 
 
 		 642 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  36.46 
 
 		 920 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  27.45 
 
 		 753 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>