More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0742 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
1861 aa  3741    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.55 
 
 
1602 aa  318  6e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.76 
 
 
1672 aa  313  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.09 
 
 
1607 aa  297  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.73 
 
 
1734 aa  283  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.94 
 
 
1722 aa  277  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.22 
 
 
1695 aa  259  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.59 
 
 
1711 aa  254  9.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.38 
 
 
1725 aa  253  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.35 
 
 
2099 aa  251  7e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  24.33 
 
 
1784 aa  215  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  23.12 
 
 
2093 aa  205  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.07 
 
 
1723 aa  186  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.37 
 
 
1741 aa  180  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.35 
 
 
1764 aa  172  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.63 
 
 
1743 aa  168  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  28.97 
 
 
1838 aa  167  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.63 
 
 
1525 aa  167  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.23 
 
 
1698 aa  164  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  23.37 
 
 
1578 aa  161  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.09 
 
 
1542 aa  159  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.16 
 
 
1561 aa  157  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  26.11 
 
 
2082 aa  158  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  23.9 
 
 
2113 aa  154  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.29 
 
 
1589 aa  151  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.82 
 
 
2113 aa  150  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  24.7 
 
 
1543 aa  149  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.7 
 
 
1543 aa  149  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.78 
 
 
2113 aa  146  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.31 
 
 
2113 aa  144  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.14 
 
 
2136 aa  144  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.33 
 
 
1711 aa  144  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  34.26 
 
 
2087 aa  143  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.11 
 
 
685 aa  143  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  28.38 
 
 
2106 aa  142  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  37.12 
 
 
2224 aa  142  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.53 
 
 
2104 aa  140  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.26 
 
 
1754 aa  139  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.52 
 
 
1770 aa  138  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.79 
 
 
1765 aa  138  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.3 
 
 
1787 aa  136  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.04 
 
 
2120 aa  137  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.65 
 
 
2213 aa  135  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.81 
 
 
1740 aa  134  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  25.53 
 
 
1704 aa  132  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.34 
 
 
1719 aa  129  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  39.84 
 
 
2125 aa  126  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.47 
 
 
1723 aa  126  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.08 
 
 
1741 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  40.09 
 
 
2124 aa  124  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.35 
 
 
2104 aa  116  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  31.75 
 
 
2104 aa  116  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.75 
 
 
2104 aa  116  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  37.17 
 
 
2097 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  23.36 
 
 
1422 aa  111  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.39 
 
 
815 aa  108  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.77 
 
 
744 aa  105  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.86 
 
 
1759 aa  97.1  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.84 
 
 
744 aa  96.3  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.66 
 
 
744 aa  95.1  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.05 
 
 
685 aa  95.1  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  23.96 
 
 
1878 aa  93.2  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0080  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.76 
 
 
829 aa  93.2  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412671 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.01 
 
 
744 aa  92.8  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26090  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  36.32 
 
 
833 aa  92.4  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00586248  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.36 
 
 
751 aa  92.4  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.58 
 
 
739 aa  92.4  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  26.76 
 
 
459 aa  92  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30 
 
 
941 aa  91.3  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03333  ATP-dependent RNA helicase  34.46 
 
 
831 aa  91.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  35.78 
 
 
797 aa  91.3  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.61 
 
 
959 aa  90.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.06 
 
 
790 aa  89.4  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2842  DEAD/DEAH box helicase-like  39.42 
 
 
321 aa  88.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.567167 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  31.19 
 
 
758 aa  88.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.05 
 
 
740 aa  87.4  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.26 
 
 
759 aa  87.4  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  23.82 
 
 
1780 aa  86.3  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.58 
 
 
768 aa  86.3  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.72 
 
 
962 aa  86.3  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.94 
 
 
803 aa  84.7  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.37 
 
 
808 aa  85.1  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.59 
 
 
815 aa  85.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2218  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.47 
 
 
861 aa  83.6  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.344745 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1686  Protein of unknown function DUF1998  35.93 
 
 
931 aa  83.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.42 
 
 
807 aa  83.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.08 
 
 
758 aa  82.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.92 
 
 
762 aa  83.2  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.62 
 
 
752 aa  82.8  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.07 
 
 
1053 aa  82.8  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.04 
 
 
972 aa  82.8  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1976  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.59 
 
 
838 aa  82.4  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.83 
 
 
751 aa  82.4  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.86 
 
 
897 aa  82.4  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.3 
 
 
868 aa  82.4  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000944502  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.95 
 
 
764 aa  82  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  32.93 
 
 
912 aa  81.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.89 
 
 
805 aa  82  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2730  DEAD/DEAH box helicase-like  32.18 
 
 
751 aa  81.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.13 
 
 
973 aa  81.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.273362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>