More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1578 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1578  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 151 aa  306  5e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1429  sensory box protein  65.96 
 
 		 148 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4613  putative PAS/PAC sensor protein  64.79 
 
 		 142 aa  190  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.444342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4629  sensory box protein  64.08 
 
 		 142 aa  186  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2624  putative PAS/PAC sensor protein  63.7 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4489  putative PAS/PAC sensor protein  64.08 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0812  putative PAS/PAC sensor protein  61.07 
 
 		 152 aa  184  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1292  putative PAS/PAC sensor protein  66.42 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3284  putative PAS/PAC sensor protein  59.31 
 
 		 148 aa  184  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2739  sensory box protein, putative  58.62 
 
 		 151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3170  putative PAS/PAC sensor protein  60.84 
 
 		 148 aa  180  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0594815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3014  putative PAS/PAC sensor protein  57.93 
 
 		 148 aa  179  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0896  sensor protein  57.81 
 
 		 158 aa  155  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.72 
 
 		 1877 aa  145  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  48.59 
 
 		 581 aa  134  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.28 
 
 		 1820 aa  134  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  48.31 
 
 		 1021 aa  130  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2076  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.28 
 
 		 481 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00773841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2052  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.28 
 
 		 481 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  48.67 
 
 		 1741 aa  126  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.9 
 
 		 929 aa  120  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.968718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0391  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.53 
 
 		 1040 aa  120  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519884  normal  0.119604 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3085  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.34 
 
 		 905 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0188  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.86 
 
 		 578 aa  118  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3160  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 		 389 aa  116  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0667  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.72 
 
 		 1036 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.9 
 
 		 1017 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0361  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  42.65 
 
 		 1254 aa  114  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4032  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.72 
 
 		 1036 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 1138 aa  111  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4361  putative PAS/PAC sensor protein  43.9 
 
 		 365 aa  111  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2986  PAS domain-containing protein  40.15 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24395  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  40.48 
 
 		 644 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  42.31 
 
 		 853 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 578 aa  107  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4845  putative PAS/PAC sensor protein  42.98 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1716  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.52 
 
 		 1238 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0474  sensory box/GGDEF family protein  40.65 
 
 		 792 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  39.69 
 
 		 541 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1787  putative PAS/PAC sensor protein  40.31 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  39.69 
 
 		 541 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  39.69 
 
 		 541 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35077  predicted protein  42.73 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  38.93 
 
 		 544 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_003296  RS03712  hypothetical protein  39.66 
 
 		 1178 aa  103  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433519  normal  0.713314 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1707  sensory box-containing diguanylate cyclase, putative  43.97 
 
 		 1057 aa  103  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1367  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.18 
 
 		 905 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0722784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0247  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.15 
 
 		 890 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2494  signal transduction histidine kinase-like protein  40 
 
 		 1317 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206751 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  42.06 
 
 		 723 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  39.23 
 
 		 680 aa  101  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4323  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.13 
 
 		 743 aa  100  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366607  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3297  hypothetical protein  37.04 
 
 		 360 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.747205  normal  0.456251 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  41.44 
 
 		 534 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  39.69 
 
 		 534 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 654 aa  99.4  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 488 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.66 
 
 		 1183 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543508  normal  0.654737 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  42.34 
 
 		 533 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4063  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.66 
 
 		 1183 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1893  LOV-regulator, Blue-light sensing  35.29 
 
 		 920 aa  98.2  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423791  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  35.04 
 
 		 539 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 366 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  39.2 
 
 		 534 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5540  sensory box histidine kinase  39.53 
 
 		 411 aa  97.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 366 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  34.97 
 
 		 366 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6934  signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 375 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0476013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 488 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 503 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  36.17 
 
 		 488 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 814 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  36.52 
 
 		 760 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 		 888 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2346  hypothetical protein  38.24 
 
 		 364 aa  94  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  33.58 
 
 		 533 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 913 aa  93.6  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 369 aa  93.6  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 901 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 		 890 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  40.74 
 
 		 507 aa  92.8  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  33.58 
 
 		 533 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 477 aa  92  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  34.35 
 
 		 544 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  32.85 
 
 		 531 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_8113  predicted protein  41.75 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00382654  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 1692 aa  90.9  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 		 812 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 334 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2087  putative PAS/PAC sensor protein  35.2 
 
 		 240 aa  90.1  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1159  PAS:GGDEF  39.5 
 
 		 748 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 959 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5263  hypothetical protein  35.25 
 
 		 345 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51933  hypothetical protein  36.52 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.216108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  33.12 
 
 		 570 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 580 aa  89  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1244  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.02 
 
 		 1090 aa  88.6  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.258549  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  35.51 
 
 		 326 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 491 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  40.52 
 
 		 463 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>