50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1422 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1422  PKD domain containing protein  100 
 
 		 400 aa  794    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  41.18 
 
 		 884 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  34.21 
 
 		 623 aa  62.8  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  44.44 
 
 		 855 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  43.43 
 
 		 712 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  42.27 
 
 		 848 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  35.92 
 
 		 1771 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  40 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  33.61 
 
 		 635 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 		 1011 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  33.06 
 
 		 635 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  40.18 
 
 		 746 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  34.69 
 
 		 1376 aa  53.9  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  35.9 
 
 		 1022 aa  53.9  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  43 
 
 		 969 aa  53.5  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  42.55 
 
 		 848 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  41.57 
 
 		 1601 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39 
 
 		 639 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  34.78 
 
 		 634 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.74 
 
 		 6885 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  31.77 
 
 		 1916 aa  50.8  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  31.4 
 
 		 816 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  38.24 
 
 		 521 aa  50.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0152  PKD  36.7 
 
 		 506 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000535415  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4525  Parallel beta-helix repeat protein  35.06 
 
 		 488 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000043731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  33.04 
 
 		 873 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  31.52 
 
 		 1057 aa  49.7  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.38 
 
 		 1212 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  39.13 
 
 		 780 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.33 
 
 		 1217 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  31.3 
 
 		 869 aa  47  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  28.42 
 
 		 3197 aa  47  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  32.52 
 
 		 2402 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  33.06 
 
 		 833 aa  46.6  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  28.95 
 
 		 1104 aa  46.6  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  28.95 
 
 		 1104 aa  46.2  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  38.26 
 
 		 2066 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  36.89 
 
 		 563 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.19 
 
 		 596 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 		 863 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  39.78 
 
 		 1150 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  29.88 
 
 		 918 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  47.14 
 
 		 461 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  32.47 
 
 		 706 aa  43.9  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  33.57 
 
 		 611 aa  43.5  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  36.9 
 
 		 792 aa  43.5  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  31.18 
 
 		 1004 aa  43.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  37.89 
 
 		 1750 aa  43.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  36.56 
 
 		 665 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  37.66 
 
 		 3197 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>