More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2020 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2020  type II secretion system protein E  100 
 
 		 386 aa  755    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453944  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.67 
 
 		 569 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.67 
 
 		 568 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.93 
 
 		 569 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.93 
 
 		 569 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.93 
 
 		 568 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.26 
 
 		 578 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.8 
 
 		 570 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2096  type IV pilus assembly protein PilB  49.35 
 
 		 571 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.8 
 
 		 570 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  47.8 
 
 		 569 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.8 
 
 		 570 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  47.67 
 
 		 569 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  47.93 
 
 		 568 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.8 
 
 		 570 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.8 
 
 		 569 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.68 
 
 		 549 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.06 
 
 		 569 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.29 
 
 		 569 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.29 
 
 		 569 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.03 
 
 		 565 aa  373  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  49.49 
 
 		 579 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.45 
 
 		 577 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.95 
 
 		 572 aa  368  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.32 
 
 		 577 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.6 
 
 		 562 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.68 
 
 		 577 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  45.34 
 
 		 574 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  47.77 
 
 		 561 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  45.6 
 
 		 574 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2630  type IV pilus assembly protein PilB  47.92 
 
 		 563 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  46.91 
 
 		 577 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  48.95 
 
 		 562 aa  362  9e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  44.59 
 
 		 566 aa  361  1e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4820  type II secretion system protein E  46.51 
 
 		 566 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.65 
 
 		 555 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.762326  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  46.98 
 
 		 561 aa  361  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  45.36 
 
 		 571 aa  360  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0863  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  44.62 
 
 		 573 aa  358  7e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58750  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  45.48 
 
 		 567 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.497058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5162  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  45.22 
 
 		 561 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3576  hypothetical protein  48.95 
 
 		 490 aa  355  5e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356057  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.68 
 
 		 574 aa  354  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5488  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.13 
 
 		 580 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.388204  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.6 
 
 		 568 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.85 
 
 		 572 aa  352  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0766  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.74 
 
 		 578 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.59759  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.26 
 
 		 571 aa  351  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0805  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.88 
 
 		 577 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3680  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.13 
 
 		 578 aa  350  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.48 
 
 		 568 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.48 
 
 		 568 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0768  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.88 
 
 		 577 aa  350  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1175  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.53 
 
 		 571 aa  349  5e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.56 
 
 		 568 aa  348  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3763  hypothetical protein  48.17 
 
 		 490 aa  348  9e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4220  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.67 
 
 		 577 aa  348  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  47.21 
 
 		 568 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.08 
 
 		 568 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0926  type IV pilus biogenesis protein PilB  45.74 
 
 		 564 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  43.49 
 
 		 570 aa  347  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0798  type II secretion system protein E  45.99 
 
 		 564 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0775  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.24 
 
 		 567 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.621188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  44.56 
 
 		 568 aa  346  4e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.82 
 
 		 568 aa  346  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.13 
 
 		 568 aa  346  5e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  44.04 
 
 		 568 aa  344  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0064  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  42.38 
 
 		 591 aa  345  1e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.978792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2902  type II secretion system protein E  45.36 
 
 		 577 aa  344  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0841  type II secretion system protein E  45.55 
 
 		 578 aa  344  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0657263  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0665  hypothetical protein  47.37 
 
 		 473 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3499  hypothetical protein  46.44 
 
 		 512 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3371  hypothetical protein  46.44 
 
 		 512 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12090  type IV pilus assembly protein  45.62 
 
 		 566 aa  344  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1042  hypothetical protein  46.44 
 
 		 518 aa  344  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0653884 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2141  type II secretion system protein E  42.68 
 
 		 569 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000466372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  46.92 
 
 		 569 aa  341  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.92 
 
 		 569 aa  341  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0509  pilus biogenesis ATPase  44.33 
 
 		 572 aa  340  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0385141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0639  type II secretion system protein E  44.33 
 
 		 571 aa  340  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.88 
 
 		 568 aa  338  7e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0777  hypothetical protein  48.43 
 
 		 481 aa  338  8e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.336131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3108  type II secretion system protein E  44.5 
 
 		 573 aa  338  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.275217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2370  type IV pilus assembly protein, PilB  45.13 
 
 		 571 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.881077  normal  0.0893992 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3506  type IV pilus biogenesis protein PilB  50.76 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3531  type IV pilus biogenesis protein PilB  50.76 
 
 		 407 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  48.28 
 
 		 497 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  48.28 
 
 		 497 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  48.28 
 
 		 497 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  48.28 
 
 		 497 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  48.28 
 
 		 497 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.53 
 
 		 571 aa  336  5e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  48.28 
 
 		 497 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  48.28 
 
 		 497 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3527  type IV fimbrial biogenesis protein,PilB  50.76 
 
 		 419 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0151  type II secretion system protein E  46.23 
 
 		 420 aa  335  5.999999999999999e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  45.67 
 
 		 558 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2531  type II/IV secretion system protein  50.51 
 
 		 419 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  48.02 
 
 		 497 aa  334  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  48.55 
 
 		 498 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>