80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0154 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0154  hypothetical protein  100 
 
 		 649 aa  1246    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0155  Rhs element Vgr protein  35.98 
 
 		 686 aa  90.5  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2821  Rhs element protein VgrE  22.62 
 
 		 690 aa  80.5  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  28.42 
 
 		 853 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  23.36 
 
 		 734 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  23.36 
 
 		 734 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  23.36 
 
 		 734 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  23.36 
 
 		 734 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  23.36 
 
 		 734 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  22.42 
 
 		 741 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  23.36 
 
 		 734 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  23.36 
 
 		 731 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  26.42 
 
 		 645 aa  61.2  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2822  putative Rhs element protein, VgrG-like  20.58 
 
 		 789 aa  61.2  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  24.83 
 
 		 731 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  24.46 
 
 		 741 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 757 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  24.63 
 
 		 741 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  25.6 
 
 		 851 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0628  Rhs element Vgr protein  25.53 
 
 		 449 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  28.78 
 
 		 671 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  27.27 
 
 		 694 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  27.03 
 
 		 702 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  28.5 
 
 		 947 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  24.6 
 
 		 680 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  28.5 
 
 		 942 aa  52.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3254  type VI secretion system Vgr family protein  25 
 
 		 787 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  28.5 
 
 		 688 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  24.4 
 
 		 734 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  31.01 
 
 		 927 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  28.5 
 
 		 808 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  32.39 
 
 		 697 aa  52.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  26.56 
 
 		 680 aa  52  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  32.39 
 
 		 706 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  32.39 
 
 		 727 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0179  Rhs element Vgr protein  26.71 
 
 		 783 aa  50.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.109522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  28.02 
 
 		 680 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  28.02 
 
 		 680 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  24.18 
 
 		 734 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  28.9 
 
 		 693 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  33.54 
 
 		 875 aa  49.7  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0863  Rhs element Vgr protein  24.9 
 
 		 1012 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  27.88 
 
 		 684 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  27.32 
 
 		 706 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  27.04 
 
 		 911 aa  48.9  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  27.85 
 
 		 767 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  32.93 
 
 		 869 aa  48.5  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  26.74 
 
 		 767 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  28.05 
 
 		 842 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  32.16 
 
 		 871 aa  48.5  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3949  Rhs element Vgr protein  29.24 
 
 		 691 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  21.21 
 
 		 645 aa  48.5  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1019 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  25.99 
 
 		 722 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  25.95 
 
 		 680 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  27.54 
 
 		 946 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  24.03 
 
 		 618 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 614 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  27.43 
 
 		 763 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  27.54 
 
 		 946 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  30.06 
 
 		 790 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  24.56 
 
 		 968 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  23.28 
 
 		 780 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1019 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  27.05 
 
 		 946 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3386  vgrG protein  27.53 
 
 		 725 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160309  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  27.92 
 
 		 895 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  29.3 
 
 		 692 aa  45.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0476  VgrG protein  27.56 
 
 		 531 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.245187  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2130  Rhs element Vgr protein  25.76 
 
 		 1007 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6319  Rhs element Vgr protein  28.69 
 
 		 1197 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0965231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4049  vgrG protein  24.73 
 
 		 771 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.253476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2032  Rhs element Vgr protein  25.76 
 
 		 1007 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  32.19 
 
 		 754 aa  44.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  27.33 
 
 		 540 aa  44.3  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  28.03 
 
 		 692 aa  44.3  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  26.47 
 
 		 901 aa  43.9  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  28.67 
 
 		 771 aa  43.9  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  25.26 
 
 		 1017 aa  43.9  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0541  Rhs element Vgr protein  25.55 
 
 		 1007 aa  43.9  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>