More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4239 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4239  response regulator receiver protein  100 
 
 
126 aa  263  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.77 
 
 
231 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.77 
 
 
231 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
935 aa  84.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  38.71 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 
231 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
231 aa  80.5  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  38.33 
 
 
1053 aa  80.1  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
916 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  38.26 
 
 
497 aa  79.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4386  histidine kinase  36.36 
 
 
411 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
602 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  35.83 
 
 
1361 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
945 aa  77.8  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
1839 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
1362 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
1857 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  36.75 
 
 
123 aa  77  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
837 aa  77  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3150  response regulator receiver protein  36.61 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.14204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  35 
 
 
1200 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 
1163 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3381  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 
902 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.247292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1896 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  35.54 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
1977 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  38.89 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1718  response regulator receiver protein  43.97 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0955826  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
1142 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
1201 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.04 
 
 
434 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.04 
 
 
434 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  33.91 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01756  Response regulator CheB (receptor modification enzyme, protein-glutamate methylesterase)  33.6 
 
 
337 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.844049  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.36 
 
 
488 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.68 
 
 
1131 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  32.77 
 
 
225 aa  74.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02240  protein-histidine kinase, putative  36.61 
 
 
1816 aa  74.3  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
2010 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 
236 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 
236 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
1127 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 
239 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 
243 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
225 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
1559 aa  73.9  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0792  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.71 
 
 
331 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3231  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.71 
 
 
331 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 
217 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  32.76 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.61 
 
 
226 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  39.25 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  39.34 
 
 
355 aa  73.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6413  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.67 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.341429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
1274 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  34.38 
 
 
1127 aa  73.2  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  34.17 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.97 
 
 
466 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
1149 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2062  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
1155 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1850  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.549411  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
1155 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
1155 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
920 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1131 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  34.17 
 
 
1574 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2864  two-component response regulator  37.96 
 
 
383 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.384945  hitchhiker  0.000000030251 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  33.33 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  32.8 
 
 
1373 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
1853 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.89 
 
 
385 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
2099 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
1954 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
964 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
1137 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0479  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.94 
 
 
350 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
1847 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  37.1 
 
 
1351 aa  72  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  34.71 
 
 
1137 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
1216 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
1177 aa  71.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  35.59 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
2099 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
1843 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 
228 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3005  response regulator receiver  37.96 
 
 
361 aa  71.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.931132  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1924  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  34.19 
 
 
367 aa  70.9  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.620973  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 
1194 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1561  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.36 
 
 
455 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734361  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  32.5 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  31.2 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>