More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2395 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
334 aa  665    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.37 
 
 
344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.45 
 
 
348 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.12 
 
 
320 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1482  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.61 
 
 
727 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2578  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  41.08 
 
 
341 aa  246  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0147  peptide ABC transporter, permease protein  42.44 
 
 
341 aa  243  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.21 
 
 
331 aa  239  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
274 aa  237  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.534309  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03425  hypothetical protein  40.25 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002584  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 2  40.13 
 
 
341 aa  232  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.37 
 
 
300 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 
309 aa  230  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.383419  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06410  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  42.6 
 
 
320 aa  225  7e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.138967  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.76 
 
 
311 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
331 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0878076  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
358 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471831  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0547  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  38.54 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
350 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01330  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  43.64 
 
 
311 aa  208  8e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1400  ABC transporter related  38.89 
 
 
638 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785888  normal  0.726008 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  44.24 
 
 
621 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.533008  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2743  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.67 
 
 
302 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.418739  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.4 
 
 
336 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.57 
 
 
342 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
292 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340693  normal  0.469526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6186  ABC transporter related  41.16 
 
 
590 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
320 aa  195  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7458  peptide ABC transporter, permease protein  41.01 
 
 
281 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
276 aa  192  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.10252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.576006 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
325 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 
279 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
279 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.1 
 
 
319 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  32.96 
 
 
279 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
282 aa  168  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.951442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00106936  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21760  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.91 
 
 
310 aa  162  9e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0612673  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
280 aa  160  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0590918  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0912  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components  34.73 
 
 
304 aa  159  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
283 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7183  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  33.56 
 
 
335 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
312 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
273 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141415  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0928  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 
274 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00180433  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
279 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17740  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.33 
 
 
331 aa  155  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00436739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
300 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
280 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284624  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001972  peptide ABC transporter permease component  35.79 
 
 
318 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
284 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
818 aa  150  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000335755  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
284 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
304 aa  150  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.580513  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0043  hypothetical protein  36.06 
 
 
269 aa  150  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.728589  normal  0.420247 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00495  ABC transporter permease component  35.12 
 
 
318 aa  149  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
306 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
281 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170759  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7556  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  32.63 
 
 
279 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
344 aa  149  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0564  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  34.54 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
286 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0893446  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.83 
 
 
314 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.176316  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
285 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2566  peptide ABC transporter, permease protein  38.43 
 
 
312 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
332 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 
285 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.35 
 
 
289 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2084  ABC transporter, permease  34.52 
 
 
293 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.741475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0811  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.43 
 
 
308 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261533  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
296 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
288 aa  143  4e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
301 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20807  normal  0.604183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
283 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.639488  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  32.78 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  33.66 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0097  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  37.08 
 
 
313 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
305 aa  140  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
308 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848897  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.66 
 
 
299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
285 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37266  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
485 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3569  dipeptide ABC transporter, permease  34.21 
 
 
257 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
299 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2012  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.57 
 
 
276 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
304 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0718  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  34.21 
 
 
455 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
291 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.532821  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  32.48 
 
 
300 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
388 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.575298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>