More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4520 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
301 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20807  normal  0.604183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5699  ABC transporter, permease  58.8 
 
 
300 aa  291  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1658  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  60.7 
 
 
302 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
290 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.204889 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
303 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
298 aa  187  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0527807 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
388 aa  186  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.575298  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 
330 aa  182  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0131606  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
343 aa  180  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
291 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125001  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
372 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.173212  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
298 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.35 
 
 
290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.377446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7446  ABC transporter, permease  39.34 
 
 
299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913354  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
346 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  41.91 
 
 
621 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.533008  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
331 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.426528  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357708  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1400  ABC transporter related  39.41 
 
 
638 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785888  normal  0.726008 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
342 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  37.21 
 
 
279 aa  155  6e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
279 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
344 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
322 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.87 
 
 
307 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  36.82 
 
 
279 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  32.87 
 
 
307 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  32.87 
 
 
307 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.53 
 
 
307 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  32.53 
 
 
307 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.34 
 
 
342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.49 
 
 
306 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  32.11 
 
 
307 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.49 
 
 
306 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0268  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 
307 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
307 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
276 aa  149  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
321 aa  149  5e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000200943 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0130  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.76 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
320 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1482  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.24 
 
 
727 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.07 
 
 
319 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
303 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.576006 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
818 aa  144  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000335755  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
331 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
282 aa  143  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.951442  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
334 aa  142  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
285 aa  142  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  0.031338 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.502248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
331 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0878076  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.91 
 
 
280 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0590918  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
280 aa  139  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0346829  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
302 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
288 aa  139  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
287 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
350 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
280 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7458  peptide ABC transporter, permease protein  34.93 
 
 
281 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0755  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  34.55 
 
 
304 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
309 aa  136  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.383419  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
274 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0043  hypothetical protein  36.29 
 
 
269 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.728589  normal  0.420247 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0912  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components  37.09 
 
 
304 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.91 
 
 
289 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03425  hypothetical protein  34.39 
 
 
341 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  34.47 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
274 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.534309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3511  oligopeptide ABC transporter (permease)  33.22 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002584  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 2  33.99 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
303 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 
304 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  33.55 
 
 
304 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
301 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
304 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06410  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.23 
 
 
320 aa  132  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.138967  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
312 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0147  peptide ABC transporter, permease protein  34.34 
 
 
341 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2084  ABC transporter, permease  36.21 
 
 
293 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.741475 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 
285 aa  132  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
471 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0657441  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1253  ABC transporter, permease protein  33.78 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000107069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.05 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2578  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  33.2 
 
 
341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01330  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.85 
 
 
311 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
349 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
468 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
301 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
320 aa  129  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>