More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2117 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
257 aa  525  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.05 
 
 
498 aa  226  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.97 
 
 
455 aa  224  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 
499 aa  224  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.77 
 
 
455 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.06 
 
 
426 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.27 
 
 
953 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3669  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.41 
 
 
432 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
989 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 
571 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
989 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0883  response regulator receiver  42.04 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  40.15 
 
 
474 aa  191  9e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 
521 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  38.49 
 
 
429 aa  188  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  39.13 
 
 
458 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.1 
 
 
704 aa  181  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  36.65 
 
 
404 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  41.34 
 
 
255 aa  170  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  38.75 
 
 
261 aa  169  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  50.59 
 
 
469 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
591 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  67.48 
 
 
143 aa  165  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  44.81 
 
 
603 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  60 
 
 
131 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  62.31 
 
 
130 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  58.96 
 
 
135 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  47.02 
 
 
429 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.32 
 
 
701 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  38.26 
 
 
461 aa  155  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  35.09 
 
 
336 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  58.4 
 
 
359 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  51.56 
 
 
238 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.74 
 
 
373 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  58.78 
 
 
376 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  34.98 
 
 
263 aa  146  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.39 
 
 
701 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.64 
 
 
386 aa  145  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  39.58 
 
 
337 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  35.77 
 
 
380 aa  144  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  57.38 
 
 
343 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  52 
 
 
352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  51.16 
 
 
636 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 
472 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  57.48 
 
 
157 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  48.98 
 
 
316 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  53.44 
 
 
377 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 
355 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  51.64 
 
 
450 aa  136  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  50.39 
 
 
450 aa  135  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.65 
 
 
817 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  41.62 
 
 
340 aa  135  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  52.71 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  35.5 
 
 
258 aa  133  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.84 
 
 
384 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0118  putative PAS/PAC sensor protein  31.33 
 
 
265 aa  126  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  43.75 
 
 
182 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1007  putative GAF sensor protein  47.06 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164021  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  48.76 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  48.33 
 
 
122 aa  118  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.13 
 
 
561 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  49.17 
 
 
126 aa  115  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  44.03 
 
 
667 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  47.11 
 
 
127 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  46.88 
 
 
194 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  47.32 
 
 
134 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  46.51 
 
 
657 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.24 
 
 
481 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2032  response regulator receiver protein  44.63 
 
 
387 aa  105  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0686114 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2576  response regulator receiver domain-containing protein  45.83 
 
 
122 aa  105  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 
249 aa  105  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  33.33 
 
 
240 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.62 
 
 
457 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1200  response regulator receiver domain-containing protein  33.53 
 
 
248 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783054  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  43.09 
 
 
134 aa  102  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.86 
 
 
651 aa  99.8  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1350  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.74 
 
 
715 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1380  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.74 
 
 
715 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.923401  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.75 
 
 
635 aa  99  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.57 
 
 
201 aa  99  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.44 
 
 
196 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.44 
 
 
196 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.02 
 
 
461 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.85 
 
 
201 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.84 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.86 
 
 
457 aa  95.9  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.71 
 
 
200 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  44.83 
 
 
153 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  39.55 
 
 
204 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.96 
 
 
220 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1609  response regulator receiver protein  43.86 
 
 
463 aa  94.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.672475  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5458  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.5 
 
 
582 aa  94.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.336827 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1374  putative PAS/PAC sensor protein  31.95 
 
 
408 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.46 
 
 
229 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.9 
 
 
471 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.62 
 
 
197 aa  93.2  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.76 
 
 
229 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.03 
 
 
195 aa  92.8  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.85 
 
 
1045 aa  93.2  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
1000 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>