More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0688 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0688  rare lipoprotein A  100 
 
 		 141 aa  290  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000610426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0601  rare lipoprotein A  62.76 
 
 		 154 aa  179  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000191646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0615  rare lipoprotein A  61.64 
 
 		 157 aa  174  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.679180000000001e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0455  lipoprotein A domain-containing protein  56.03 
 
 		 150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3379  rare lipoprotein A  56.03 
 
 		 150 aa  160  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0489  rare lipoprotein A  61.7 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0379  rare lipoprotein A  54.37 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0364782  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  48.98 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0747  rare lipoprotein A, putative  49.45 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479565  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  52.04 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  47.96 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  47.96 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  55.17 
 
 		 163 aa  97.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  43.93 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  54.64 
 
 		 166 aa  97.1  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  47.96 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  42.97 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  47.96 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  53.26 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  40.56 
 
 		 171 aa  94  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  48.45 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  48.45 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  53.41 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0689  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  37.31 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  50.57 
 
 		 165 aa  90.5  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 367 aa  89.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  50 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  47.25 
 
 		 213 aa  88.6  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  54.12 
 
 		 175 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  45.65 
 
 		 360 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  45.65 
 
 		 360 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  45.36 
 
 		 163 aa  87.4  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  44.9 
 
 		 286 aa  87.8  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  49.49 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  47.42 
 
 		 242 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  47.42 
 
 		 242 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  47.42 
 
 		 230 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  47.42 
 
 		 230 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  47.42 
 
 		 211 aa  87  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  47.42 
 
 		 211 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  47.42 
 
 		 211 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  47.42 
 
 		 211 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  49.46 
 
 		 370 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  46 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  49.49 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  47.25 
 
 		 371 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  44.9 
 
 		 246 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  49.49 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  44.57 
 
 		 358 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  46.39 
 
 		 186 aa  85.5  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  40 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  47.73 
 
 		 262 aa  84.7  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  47.83 
 
 		 324 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  47.87 
 
 		 278 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  44.55 
 
 		 322 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  46.74 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 323 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  47 
 
 		 285 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  45.54 
 
 		 249 aa  84.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 199 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4774  rare lipoprotein A  43.88 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  hitchhiker  0.000486811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  39.67 
 
 		 303 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  44.66 
 
 		 270 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  39.86 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  44.86 
 
 		 238 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  48.89 
 
 		 251 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 265 aa  84  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4279  rare lipoprotein A  47.73 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 212 aa  84  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  42.27 
 
 		 297 aa  84  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  47.78 
 
 		 234 aa  83.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4056  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.926393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  48.35 
 
 		 202 aa  83.6  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  47.31 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  43.55 
 
 		 273 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  43.55 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  48.35 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  45.05 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  46.08 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  47.67 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  39.17 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  46.24 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  45.45 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  43.88 
 
 		 293 aa  82  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4680  rare lipoprotein A  41.12 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  45.05 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  45.56 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  45.05 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3465  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3137  rare lipoprotein A  45.56 
 
 		 250 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4083  rare lipoprotein A  50 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  42.72 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 381 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  45.05 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>