More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4089 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 401 aa  779    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  63.18 
 
 		 422 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  64.12 
 
 		 388 aa  483  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  65.06 
 
 		 387 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  64.07 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  64.32 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  61.88 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  64.32 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  64.29 
 
 		 398 aa  472  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  65.23 
 
 		 390 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  64.8 
 
 		 384 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  64.21 
 
 		 399 aa  474  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  63.9 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  64.71 
 
 		 391 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13041  cysteine desulfurase iscS  63.32 
 
 		 393 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315275  hitchhiker  0.00290952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  60.97 
 
 		 387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  60.9 
 
 		 412 aa  448  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  58.88 
 
 		 408 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  62.28 
 
 		 418 aa  444  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  62.81 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  61.36 
 
 		 390 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  61.6 
 
 		 391 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  58.42 
 
 		 407 aa  430  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1106  aminotransferase class V  65.47 
 
 		 391 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  61.44 
 
 		 416 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  60.97 
 
 		 400 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1213  aminotransferase, class V  66.24 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.885701  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  63.96 
 
 		 401 aa  422  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  57.47 
 
 		 412 aa  421  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  58.65 
 
 		 413 aa  415  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  58.78 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1307  aminotransferase class V  61.28 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  43.8 
 
 		 394 aa  342  8e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  48.72 
 
 		 399 aa  341  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  44.1 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  44.56 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  45.76 
 
 		 388 aa  322  5e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  46.73 
 
 		 409 aa  322  7e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  41.9 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  42.42 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  44.33 
 
 		 396 aa  320  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  42.78 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 384 aa  319  7e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  43.59 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  43.08 
 
 		 392 aa  316  4e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  46.84 
 
 		 390 aa  315  6e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  45.94 
 
 		 388 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  45.01 
 
 		 398 aa  312  6.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14810  cysteine desulfurase family protein  49.87 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  43.7 
 
 		 396 aa  308  8e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  45.24 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  43.08 
 
 		 392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  40.31 
 
 		 404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  44.72 
 
 		 394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  42.67 
 
 		 394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1361  aminotransferase class V  53 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  43.04 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  42.35 
 
 		 398 aa  302  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  48 
 
 		 385 aa  302  7.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  41.22 
 
 		 398 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  41.22 
 
 		 398 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  41.79 
 
 		 414 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  46.97 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  43.69 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  41.94 
 
 		 398 aa  296  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  39.29 
 
 		 393 aa  296  5e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  49.62 
 
 		 377 aa  296  6e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  43.7 
 
 		 379 aa  295  9e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  42.35 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  42.05 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.05 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  40.82 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  41.58 
 
 		 401 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  40.41 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  36.92 
 
 		 382 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  45.5 
 
 		 381 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  39.9 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  39.74 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  41.33 
 
 		 383 aa  280  4e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  41.58 
 
 		 383 aa  280  4e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  42.93 
 
 		 404 aa  280  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  40.87 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  45.41 
 
 		 393 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  39.29 
 
 		 401 aa  278  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  42.05 
 
 		 396 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  39.85 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  40.97 
 
 		 417 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  42.6 
 
 		 382 aa  272  6e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  40.26 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  39.9 
 
 		 389 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  47.16 
 
 		 381 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  35.88 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  44.13 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  41.85 
 
 		 502 aa  270  4e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  44.39 
 
 		 388 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  40.66 
 
 		 400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  42.2 
 
 		 394 aa  269  8e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  47.42 
 
 		 381 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  37.28 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  44.39 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>