77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2676 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  639    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  60.64 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  63.14 
 
 		 297 aa  335  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  59.93 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  60 
 
 		 351 aa  324  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  57.81 
 
 		 303 aa  322  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  57.6 
 
 		 311 aa  318  9e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  56.9 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  61.8 
 
 		 286 aa  315  7e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  60.97 
 
 		 295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  57.34 
 
 		 277 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  57.34 
 
 		 277 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  57.34 
 
 		 277 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  56.81 
 
 		 303 aa  302  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  54.1 
 
 		 304 aa  300  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  57.84 
 
 		 266 aa  299  4e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  55.79 
 
 		 278 aa  299  5e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  59.77 
 
 		 294 aa  298  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  56.21 
 
 		 302 aa  297  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  56.55 
 
 		 267 aa  295  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  58.52 
 
 		 334 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  55.79 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  55.27 
 
 		 297 aa  292  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  54.45 
 
 		 313 aa  286  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  50.7 
 
 		 323 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  52.65 
 
 		 284 aa  276  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  54.65 
 
 		 273 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  51.66 
 
 		 280 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  53.41 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  44.52 
 
 		 298 aa  223  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  36.02 
 
 		 259 aa  135  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  28.14 
 
 		 366 aa  86.7  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  24.56 
 
 		 1019 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  31.75 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  25.46 
 
 		 615 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  28.38 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  28.03 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  31.5 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  29.23 
 
 		 302 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  28.3 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  29.23 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  22.71 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  25.09 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  26.74 
 
 		 1052 aa  62.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  25.84 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  21.67 
 
 		 1016 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  27.21 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.3 
 
 		 1048 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  27.54 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  24.36 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  23.44 
 
 		 276 aa  54.3  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  25.95 
 
 		 379 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  28.09 
 
 		 387 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  28.09 
 
 		 387 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  28.09 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  28.09 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  25 
 
 		 543 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  26.22 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  29.7 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  32.43 
 
 		 976 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  27.27 
 
 		 781 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  24.91 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  26.79 
 
 		 387 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  27.78 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  32.69 
 
 		 1014 aa  50.1  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  27.17 
 
 		 988 aa  49.3  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  27.78 
 
 		 783 aa  47.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  33.61 
 
 		 1110 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 		 1040 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  30.34 
 
 		 1164 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  22.46 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  25.74 
 
 		 1106 aa  43.5  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  24.6 
 
 		 951 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  41.67 
 
 		 957 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  37.5 
 
 		 993 aa  42.7  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  24.44 
 
 		 267 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0518  hypothetical protein  37.25 
 
 		 1077 aa  42.4  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>