More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2661 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 282 aa  535  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5387  alpha/beta hydrolase  42.75 
 
 		 290 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3471  alpha/beta hydrolase  39.03 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1827  hydrolase  39.92 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2686  alpha/beta hydrolase fold protein  34.28 
 
 		 310 aa  115  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.698481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2694  alpha/beta fold family hydrolase  24.11 
 
 		 290 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00231525  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17930  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.33 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1006  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 		 324 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  27.55 
 
 		 281 aa  92.4  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5749  Alpha/beta hydrolase  42.75 
 
 		 408 aa  92.4  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5789  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 		 306 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.0718304 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5013  carboxylesterase Na  29.62 
 
 		 315 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257907  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1509  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000127113 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5547  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 297 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  40.77 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2422  alpha/beta hydrolase fold  40.77 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00445003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  40.77 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3473  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4023  alpha/beta hydrolase fold protein  45.63 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 		 268 aa  72  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  37.6 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  29.96 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  30.19 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  29.32 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  41.51 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  41.96 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  38.17 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5645  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530376  normal  0.570131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  40.57 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  29.1 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  29.1 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  32.81 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  39.06 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0318  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.35 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.22 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  35.54 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.39 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  42.86 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  42.03 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  37.24 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2776  lipase  31.03 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000301548 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  41.58 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2549  lipase  31.03 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4695  hypothetical protein  32.37 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621835  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.24 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  33.06 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  28.29 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  35.64 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  39.13 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.15 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  40.4 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 		 387 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 340 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  37.14 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  29.22 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  31.02 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  37.37 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  39.39 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>