More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1600 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  100 
 
 		 339 aa  650    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  54.95 
 
 		 330 aa  293  4e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  59.85 
 
 		 277 aa  291  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  52.79 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  58.61 
 
 		 300 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  50.69 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  52.75 
 
 		 283 aa  250  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  51.48 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  50.69 
 
 		 291 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  52.4 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  54.17 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  50.17 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  52.38 
 
 		 310 aa  228  9e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  50.17 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  48.58 
 
 		 308 aa  215  8e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  54 
 
 		 312 aa  206  6e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  39.22 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2185  ABC-3 protein  53.12 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0841161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  36.15 
 
 		 277 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  37.22 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  44.19 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  40.94 
 
 		 285 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  41.04 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  39.62 
 
 		 274 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  39.39 
 
 		 265 aa  162  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  39 
 
 		 274 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 		 277 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 		 277 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  41.06 
 
 		 272 aa  159  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  37.84 
 
 		 281 aa  159  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  36.72 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  40.54 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  36.54 
 
 		 277 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  35.88 
 
 		 269 aa  157  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  36.15 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  36.15 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  36.15 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  36.15 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  36.15 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  36.15 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  37.45 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  38.27 
 
 		 279 aa  155  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  39.31 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  36.15 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  33.07 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  34.91 
 
 		 280 aa  152  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  36.74 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  36.72 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  32.05 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  35.09 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  34.51 
 
 		 361 aa  149  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  33.69 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1009  ABC-3 protein  42.86 
 
 		 320 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.864655  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  35.91 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  37.17 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  34.12 
 
 		 272 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  37.77 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  31.91 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  32.75 
 
 		 281 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  35.48 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.12 
 
 		 270 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 		 273 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  37.65 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  37.07 
 
 		 277 aa  139  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0853  ABC-3 protein  36.64 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  31.02 
 
 		 271 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  32.82 
 
 		 266 aa  136  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3478  ABC-3 protein  35.59 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  36.43 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  31.18 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  36.43 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  30.12 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 		 282 aa  134  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  31.01 
 
 		 275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  31.89 
 
 		 290 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  31.89 
 
 		 290 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  33.09 
 
 		 277 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  35.16 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  33.81 
 
 		 371 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  36.68 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  27.8 
 
 		 272 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  28.85 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  31.79 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  32.01 
 
 		 288 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  36.29 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  37.31 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  30.8 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  33.07 
 
 		 275 aa  126  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18250  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  38.04 
 
 		 283 aa  126  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  35.06 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  32.66 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  32.66 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  35.32 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  37.94 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  32.66 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 269 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>