45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1516 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  100 
 
 		 481 aa  937    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  41.83 
 
 		 627 aa  335  9e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  38.27 
 
 		 505 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  40.13 
 
 		 648 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.95 
 
 		 486 aa  302  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  39.69 
 
 		 480 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  39.47 
 
 		 488 aa  300  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  39.88 
 
 		 666 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  41.08 
 
 		 472 aa  292  7e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  40.04 
 
 		 497 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.29 
 
 		 484 aa  271  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  34.21 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.53 
 
 		 514 aa  267  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.26 
 
 		 474 aa  264  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.73 
 
 		 603 aa  249  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  34.9 
 
 		 481 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  32.93 
 
 		 634 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.26 
 
 		 695 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  32.98 
 
 		 647 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  32.48 
 
 		 484 aa  204  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  35.78 
 
 		 475 aa  197  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.73 
 
 		 501 aa  186  6e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  30.81 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  32.84 
 
 		 603 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  29.17 
 
 		 476 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  28.08 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 		 487 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  26.23 
 
 		 447 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  27.42 
 
 		 485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  28.41 
 
 		 982 aa  140  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 		 445 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  25.35 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  25.85 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  26.85 
 
 		 447 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  23.71 
 
 		 567 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  24.94 
 
 		 726 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  23.96 
 
 		 688 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  21.46 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  23.2 
 
 		 859 aa  68.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  25.69 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  25.42 
 
 		 801 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  22.52 
 
 		 413 aa  53.5  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  22.08 
 
 		 801 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  21.85 
 
 		 803 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>