More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1332 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  100 
 
 
218 aa  417  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  48.97 
 
 
208 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  51.71 
 
 
204 aa  149  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  47.21 
 
 
197 aa  148  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  47.96 
 
 
200 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  44.44 
 
 
207 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  39.44 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  36.14 
 
 
211 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  38.12 
 
 
218 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  40 
 
 
199 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  41.5 
 
 
198 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 
253 aa  101  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  30.9 
 
 
197 aa  97.8  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  36.45 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  45.39 
 
 
215 aa  94.7  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  38.14 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  39.72 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  37.93 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  42.42 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  38.36 
 
 
210 aa  92  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  38.82 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  36.22 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  38.53 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  41.83 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  40.97 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  43.45 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  38.1 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  37.88 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  37.88 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  37.88 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  44.2 
 
 
221 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  37.58 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  31.28 
 
 
201 aa  84.7  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  40.57 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  36.14 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  38.56 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  46.09 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  36.84 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  42.14 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  36.89 
 
 
226 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  34.78 
 
 
227 aa  81.3  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  31.32 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  35.71 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  36.5 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  28.48 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  28.48 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  27.56 
 
 
199 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  45.97 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  26.92 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  35.8 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  37.23 
 
 
544 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  34.64 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  27.15 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  34.64 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  32.92 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  36.3 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  32.26 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  34.5 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  38.69 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  33.12 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  45.86 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  38.81 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  26.25 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  26.25 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  40.83 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  36.57 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  31.36 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  36.09 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  27.27 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  25.52 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  28.22 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
200 aa  63.5  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  32.8 
 
 
290 aa  62.4  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  31.52 
 
 
201 aa  62.4  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  30.65 
 
 
149 aa  62.4  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  31.17 
 
 
204 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  34.56 
 
 
206 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 
199 aa  61.6  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  32.82 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  26 
 
 
167 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  29.29 
 
 
208 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  31.48 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  32.72 
 
 
177 aa  58.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 
305 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  41.18 
 
 
249 aa  58.2  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  41.75 
 
 
396 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  27.72 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  30.33 
 
 
541 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  25.84 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 
202 aa  55.8  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  34.93 
 
 
187 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  37.25 
 
 
190 aa  55.5  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  38.53 
 
 
251 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0145  thiopurine S-methyltransferase  35.96 
 
 
210 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285436  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>