More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0466 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0466  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 306 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.614226  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5343  prephenate dehydrogenase  41.4 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5050  prephenate dehydrogenase  41.4 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13786  prephenate dehydrogenase  41.08 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.791887 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4962  prephenate dehydrogenase  41.39 
 
 		 314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308401  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0236  Prephenate dehydrogenase  47.84 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1212  prephenate dehydrogenase  42.38 
 
 		 314 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.827546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5596  prephenate dehydrogenase  42.62 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0168  prephenate dehydrogenase  45.32 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.538726  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26030  prephenate dehydrogenase  45.64 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4050  Prephenate dehydrogenase  40.26 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36910  prephenate dehydrogenase  40.39 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0799  Prephenate dehydrogenase  41.27 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.253718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0308  Prephenate dehydrogenase  44.05 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  42.15 
 
 		 361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  44.8 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0968  Prephenate dehydrogenase  43.82 
 
 		 331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  37.5 
 
 		 286 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3757  prephenate dehydrogenase  46.7 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.673917  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0249  prephenate dehydrogenase  37.55 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.524671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  42.65 
 
 		 375 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  40.08 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2051  Prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.129678  decreased coverage  0.0000000000498492 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  31.25 
 
 		 368 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  38.78 
 
 		 369 aa  112  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.84 
 
 		 735 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  39.66 
 
 		 746 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.3 
 
 		 746 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.61 
 
 		 746 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  39.02 
 
 		 369 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  41.8 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  31.52 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2828  Prephenate dehydrogenase  46.15 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00010638  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  33.02 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  30.71 
 
 		 369 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  41.15 
 
 		 369 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 373 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.2 
 
 		 746 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1208  prephenate dehydrogenase  41.35 
 
 		 355 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  32.56 
 
 		 278 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  36.44 
 
 		 535 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  32.65 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  34.94 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  38.02 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  34.98 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  32.24 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  31.56 
 
 		 366 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  32.24 
 
 		 366 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  31.71 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  37.45 
 
 		 534 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.96 
 
 		 748 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  32.24 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  29.55 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  39.29 
 
 		 752 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  32.24 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  36.24 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.71 
 
 		 742 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  32.24 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  36.11 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  32.92 
 
 		 379 aa  103  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0483  prephenate dehydrogenase  35.08 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  34.22 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.55 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1945  arogenate dehydrogenase  42.54 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.877441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  38.5 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  33.58 
 
 		 294 aa  102  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  33.84 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  31.84 
 
 		 366 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1163  prephenate dehydrogenase  29.37 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  36.96 
 
 		 356 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.36 
 
 		 746 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  36.74 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0943  prephenate dehydrogenase  27.66 
 
 		 276 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000180721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  34.1 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  35.27 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  35.27 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  34.1 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.06 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0216  prephenate dehydrogenase  27.8 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00047126  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1495  prephenate dehydrogenase  41.64 
 
 		 363 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.970852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3118  prephenate dehydrogenase  39.06 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.724958  hitchhiker  0.00209537 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  32.06 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1638  Prephenate dehydrogenase  37.6 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  34.71 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  29.91 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  32.84 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  31.8 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.11 
 
 		 750 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1908  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  31.94 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.28 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1685  prephenate dehydrogenase  26.47 
 
 		 276 aa  99.8  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  34.9 
 
 		 292 aa  99.4  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.69 
 
 		 313 aa  99  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  34.07 
 
 		 288 aa  99  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16841  arogenate dehydrogenase  36.52 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  36.48 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  35.11 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22941  arogenate dehydrogenase  37.91 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  26.69 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>