More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1034 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1034  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
158 aa  325  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2658  putative PAS/PAC sensor protein  76.98 
 
 
145 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0214  putative PAS/PAC sensor protein  71.11 
 
 
144 aa  210  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1202  putative PAS/PAC sensor protein  72.73 
 
 
144 aa  208  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3701  putative PAS/PAC sensor protein  67.67 
 
 
145 aa  200  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0483  putative PAS/PAC sensor protein  56.15 
 
 
147 aa  167  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000401014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0466  putative PAS/PAC sensor protein  56.15 
 
 
147 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.98341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3152  sensory box protein  59.06 
 
 
151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0298  putative PAS/PAC sensor protein  55.71 
 
 
149 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.169835  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3172  putative PAS/PAC sensor protein  57.36 
 
 
151 aa  160  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.920236  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3857  putative PAS/PAC sensor protein  50.37 
 
 
145 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.759378  normal  0.914632 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6742  putative PAS/PAC sensor protein  48.8 
 
 
143 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.63921  normal  0.585827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2761  putative PAS/PAC sensor protein  47.2 
 
 
143 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0362  putative PAS/PAC sensor protein  47.79 
 
 
141 aa  141  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0993  putative PAS/PAC sensor protein  47.69 
 
 
146 aa  141  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5550  putative PAS/PAC sensor protein  49.59 
 
 
141 aa  140  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1710  putative PAS/PAC sensor protein  46.21 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.010044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1781  putative PAS/PAC sensor protein  46.21 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2168  putative PAS/PAC sensor protein  46.21 
 
 
144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.242596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4051  putative PAS/PAC sensor protein  48.09 
 
 
142 aa  137  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1206  PAS sensor protein  48.8 
 
 
149 aa  137  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4841  putative PAS/PAC sensor protein  45.86 
 
 
143 aa  137  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0488  putative PAS/PAC sensor protein  45.11 
 
 
148 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1366  putative PAS/PAC sensor protein  48 
 
 
149 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4662  PAS  47.33 
 
 
145 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1145  putative PAS/PAC sensor protein  46.4 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3616  putative PAS/PAC sensor protein  43.51 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62766  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5581  putative PAS/PAC sensor protein  43.85 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.595222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4485  putative PAS/PAC sensor protein  42.65 
 
 
145 aa  130  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2500  putative PAS/PAC sensor protein  44.12 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0282  transcriptional regulator  45.65 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.283126  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2133  putative PAS/PAC sensor protein  52.68 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0639  putative PAS/PAC sensor protein  44.7 
 
 
142 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2802  putative PAS/PAC sensor protein  40.77 
 
 
152 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.540476  normal  0.477024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1568  transcriptional regulator  34.88 
 
 
139 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683844  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3803  PAS  39.68 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051055 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2007  putative PAS/PAC sensor protein  37.96 
 
 
692 aa  82  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259838  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
620 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0076  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.1 
 
 
898 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 
1158 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 
1085 aa  77.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 
1088 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 
1313 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  31.75 
 
 
732 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
368 aa  77  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1538  putative PAS/PAC sensor protein  32.43 
 
 
495 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
674 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 
1548 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
543 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1191  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.84 
 
 
836 aa  73.9  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.668547  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.04 
 
 
728 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
739 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
1374 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
657 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1362  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.05 
 
 
862 aa  71.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.525156  hitchhiker  0.0000167572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.02 
 
 
740 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.13 
 
 
1248 aa  70.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
1676 aa  70.5  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0431  putative PAS/PAC sensor protein  56.9 
 
 
67 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00281975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.4 
 
 
2468 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
851 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 
502 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 
881 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2366  two component sensor histidine kinase  33.05 
 
 
1154 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0469089  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2469  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 
747 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
1721 aa  69.7  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
857 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3508  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
554 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.254838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
1171 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
695 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1091  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.28 
 
 
424 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  29.01 
 
 
821 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  29.01 
 
 
821 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
907 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  29.01 
 
 
821 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  29.01 
 
 
723 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  29.01 
 
 
723 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  29.01 
 
 
723 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
499 aa  68.2  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 
1049 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  29.01 
 
 
723 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2057  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
774 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.906607  hitchhiker  0.00133985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2470  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.06 
 
 
693 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000343207  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1295  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.46 
 
 
568 aa  67.8  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.38 
 
 
524 aa  67.8  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0531  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
1193 aa  67.8  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  29.6 
 
 
1589 aa  67.4  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
347 aa  67.4  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2969  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
634 aa  67.4  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
671 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 
807 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2374  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  30.43 
 
 
693 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185954  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
844 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
775 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
630 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1658  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  30.43 
 
 
693 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000881395  normal  0.485091 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.46 
 
 
705 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263072  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2785  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.84 
 
 
648 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
631 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.172451  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2315  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.58 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>