256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3747 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3747  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 434 aa  844    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2535  ATP-binding region ATPase domain protein  32.76 
 
 		 666 aa  133  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  47.96 
 
 		 851 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  32.24 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  33.83 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3447  putative signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 894 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4834  putative signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 782 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 767 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.91 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  41.58 
 
 		 783 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 564 aa  63.2  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.82 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  31.66 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 770 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  39.18 
 
 		 772 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12538  two-component sensor histidine kinase  25.47 
 
 		 606 aa  60.1  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0257303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1089  putative signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0318724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 775 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  29.67 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7054  putative signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  27.66 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 801 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  34.06 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 		 449 aa  57  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 640 aa  57  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 477 aa  57  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  31.98 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  28.04 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5558  histidine kinase  37.23 
 
 		 620 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 594 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 595 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  38.95 
 
 		 309 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 596 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  41.49 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  29.72 
 
 		 489 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.04 
 
 		 731 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2085  putative signal transduction histidine kinase  22.12 
 
 		 680 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0890651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 775 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  28.48 
 
 		 470 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  42.16 
 
 		 640 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1608  histidine kinase  41.28 
 
 		 565 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 400 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1667  ATPase domain-containing protein  31.63 
 
 		 384 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1133  putative signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  33.94 
 
 		 407 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1984  histidine kinase  31.63 
 
 		 373 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  37.63 
 
 		 282 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0050  putative signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 739 aa  53.5  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.300283  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  31.88 
 
 		 422 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 421 aa  53.5  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 480 aa  53.5  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0729  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 398 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.29297  normal  0.836482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  25.6 
 
 		 619 aa  53.1  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  27.18 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 517 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 458 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  28.7 
 
 		 598 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3951  histidine kinase  25.43 
 
 		 625 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283359 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 598 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  25.51 
 
 		 1037 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1530  sensor histidine kinase  24.38 
 
 		 191 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00284281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 700 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 801 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  25.24 
 
 		 967 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 550 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 544 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 501 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 478 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2483  histidine kinase  29.04 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0411509  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  29.22 
 
 		 325 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1496  putative signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 462 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0938967  normal  0.650695 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4905  ATPase domain-containing protein  30.29 
 
 		 496 aa  51.2  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.92947  normal  0.728538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 545 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4281  putative signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 408 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 348 aa  50.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 419 aa  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 771 aa  50.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  24.13 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.08 
 
 		 456 aa  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 334 aa  50.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.35 
 
 		 682 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 546 aa  50.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  27.07 
 
 		 1048 aa  49.7  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  28.71 
 
 		 799 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>