190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3417 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
186 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  68.65 
 
 
187 aa  266  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.46 
 
 
188 aa  184  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0230  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  54.89 
 
 
184 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.09 
 
 
185 aa  167  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.73 
 
 
191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4615  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.83 
 
 
193 aa  154  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.51 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28040  dihydrofolate reductase  45.86 
 
 
183 aa  134  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.160923  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.54 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  38.38 
 
 
199 aa  108  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.17 
 
 
188 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  38.17 
 
 
188 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  36.76 
 
 
189 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  38.38 
 
 
188 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.23 
 
 
186 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
188 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  34.22 
 
 
190 aa  99  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  39.46 
 
 
190 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  34.43 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.43 
 
 
176 aa  94.4  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 
190 aa  92.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.07 
 
 
176 aa  91.3  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 
183 aa  91.3  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  33.68 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.76 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.22 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  32.79 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.53 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  31.55 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.21 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  31.18 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.47 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.9 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.19 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  29.47 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  27.96 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.7 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.1 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  29.47 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  31.44 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  27.81 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.79 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  29.56 
 
 
195 aa  64.3  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.17 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  27.51 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.04 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.57 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.49 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
209 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  28.34 
 
 
183 aa  61.2  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
192 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  29.59 
 
 
182 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.81 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  28.42 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  29.57 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  29.79 
 
 
200 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  32.11 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.51 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.03 
 
 
176 aa  58.9  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  27.66 
 
 
182 aa  58.2  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.89 
 
 
181 aa  58.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  27.37 
 
 
179 aa  58.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38 
 
 
177 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.02 
 
 
193 aa  58.2  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  29.95 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  27.81 
 
 
180 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  29.79 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  27.37 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.04 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.92 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  31.61 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.26 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.02 
 
 
183 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  28.19 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.19 
 
 
183 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.09 
 
 
188 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.98 
 
 
185 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  29.73 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
202 aa  55.1  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.2 
 
 
189 aa  55.1  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.46 
 
 
186 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  26.26 
 
 
177 aa  53.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3984  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.7 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  36.3 
 
 
182 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.49 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.31 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  26 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  24.35 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.73 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.35 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>